人类曼氏血吸虫近交：宿主特异性因素是否塑造寄生虫种群遗传组成的数据

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源站：https://doi.org/10.5061/dryad.6nm40

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数据集大小约 155.2 KB。

数据说明

宿主种群的大小、结构和分布是决定寄生虫种群遗传组成的关键因素。尽管在进化和流行病学上具有重要意义，但关于宿主异质性如何影响寄生虫种群进化轨迹的研究却很少。我们评估了塞内加尔北部曼氏血吸虫寄生虫自然种群的遗传组成。从三个村庄的14个螺类和57个人类宿主中共采集了1346个寄生虫，并使用九个微卫星标记对每个寄生虫进行了基因分型。记录了人类宿主的人口统计学参数（年龄、性别和居住村庄）以及与埃及血吸虫的共感染情况，并量化了曼氏血吸虫的感染强度。F统计和聚类分析显示，寄生虫遗传变异在村庄和宿主之间呈随机分布（泛交），证实了人类宿主作为血吸虫“遗传混合碗”的概念。宿主性别和居住村庄与寄生虫遗传学没有任何关联。

然而，宿主年龄与寄生虫的近交和杂合度显著相关，儿童比成人更多地感染了亲缘关系较近的寄生虫。这些模式可能由以下原因解释：(1) 基因型依赖的“伴随免疫”，导致随着宿主年龄增长，选择性招募遗传上无关的蠕虫；和/或(2) “遗传混合碗”假说，即较年长的宿主比儿童暴露于更多种类的寄生虫株。本研究表明，宿主特异性因素可能塑造血吸虫种群的遗传组成，为自然系统中宿主-寄生虫相互作用提供了重要见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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