加州西北部野生鸟类中的伯氏疏螺旋体螺旋体:与生态因素、鸟类行为和蜱感染的关系数据

该数据集来自 Dryad,对应 2016 年发表的一项研究,关注美国加州西北部野生鸟类作为亚成蜱 Ixodes pacificus 宿主及莱姆病螺旋体 Borrelia burgdorferi sensu stricto 潜在储存宿主的作用

DryadDryad
dryad
浏览 2
表格回归bird behaviorBorrelia burgdorferiPasseriformesAcariPiciformeswildlife disease reservoirsIxodes pacificusHoloceneFASTA format
Data from: Borrelia burgdorferi sensu lato spirochetes in wild birds in northwestern California: associations with ecological factors, bird behavior and tick infestation

基本信息

模态
表格
大小
0.000282603 GB
任务类型
回归
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

加州西北部野生鸟类中的伯氏疏螺旋体螺旋体:与生态因素、鸟类行为和蜱感染的关系数据

Data from: Borrelia burgdorferi sensu lato spirochetes in wild birds in northwestern California: associations with ecological factors, bird behavior and tick infestation

该数据集来自 Dryad,对应 2016 年发表的一项研究,关注美国加州西北部野生鸟类作为亚成蜱 Ixodes pacificus 宿主及莱姆病螺旋体 Borrelia burgdorferi sensu stricto 潜在储存宿主的作用。数据覆盖 53 种、共 623 只鸟,采集到 284 只 I. pacificus 幼虫和若虫。研究使用广义线性模型和零膨胀负二项模型,分析鸟类行为、分类关系及蜱感染与伯氏疏螺旋体感染之间的关联。可用于研究鸟类在蜱媒病原体传播中的生态角色及相关生态因素(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2016。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):尽管伯氏疏螺旋体 sensu lato(s.l.)在多种脊椎动物中均有发现,但北美大多数研究都集中于哺乳动物作为螺旋体储存宿主的作用。我们调查了鸟类作为亚成 Ixodes pacificus 蜱宿主以及美国加州西北部莱姆病螺旋体 B. burgdorferi sensu stricto(s.s.)潜在储存宿主的角色。总体而言,623 只鸟、代表 53 个物种,共采集到 284 只 I. pacificus 幼虫和若虫。我们使用广义线性模型和零膨胀负二项模型,确定鸟类行为、分类关系以及 I. pacificus 感染与鸟类伯氏疏螺旋体感染之间的关联。鸟类的感染状态最佳解释因素为分类目、感染若虫数量、采样年份以及经对数转换的平均体重。幼虫和若虫的存在及数量可被预

【主题与分类】

主题标签:bird behavior、Borrelia burgdorferi、Passeriformes、Acari、Piciformes、wildlife disease reservoirs、Ixodes pacificus、Holocene、FASTA format。本站分类:感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.p3b61

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.5061/dryad.p3b61

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 282.6 KB。

数据说明

尽管在北美,伯氏疏螺旋体广义种(B. burgdorferi sensu lato, s.l.)存在于多种脊椎动物中,但大多数研究集中于哺乳动物作为螺旋体储存宿主的角色。我们研究了鸟类作为亚成体太平洋硬蜱(Ixodes pacificus)宿主及加利福尼亚西北部莱姆病螺旋体伯氏疏螺旋体狭义种(B. burgdorferi sensu stricto, s.s.)潜在储存宿主的作用。总体而言,代表53种的623只鸟共采集到284只太平洋硬蜱幼虫和若虫。我们运用广义线性模型和零膨胀负二项模型,探究鸟类行为、分类关系及太平洋硬蜱寄生与鸟类伯氏疏螺旋体感染之间的关联。鸟类感染状态的最佳解释因素为分类目、寄生若虫数量、采样年份及对数转换后的平均体重。幼虫和若虫的存在及数量可通过地面或树皮觅食行为及与密集橡树林地的接触来预测。分子分析首次报道了在鸟类中检测到比塞蒂氏疏螺旋体(Borrelia bissettii)。

此外,我们的数据表明,金冠带鹀(Zonotrichia atricapilla)作为一种非留鸟物种,可能是伯氏疏螺旋体狭义种(B. burgdorferi s.s.)的重要储存宿主。在12只携带伯氏疏螺旋体广义种(B. burgdorferi s.l.)感染幼虫的个体鸟类(9个物种)中,没有任何一只鸟血液中所携带的伯氏疏螺旋体广义种基因种与其身上移除的感染幼虫中所存在的基因种相同。本文讨论了这种差异的可能原因。我们的研究首次明确将分类学关系和鸟类行为同时作为预测变量,以识别伯氏疏螺旋体广义种的推定鸟类储存宿主。我们的发现强调了鸟类行为对于解释这些动物局部蜱虫侵染和伯氏疏螺旋体感染的重要性,并提示了在美国远西部地区,鸟类可能介导媒介蜱和螺旋体的地理传播。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案