肠出血性大肠杆菌O157:H7 Sakai株与TW14359株比较:分泌与胞质iTRAQ分析;TW14359 sepD分泌组分析
研究对EHEC O157:H7 Sakai与TW14359的分泌及胞质蛋白进行iTRAQ和LTQ Orbitrap质谱比较,样品经强阳离子交换与HPLC分级

基本信息
资源简介
肠出血性大肠杆菌O157:H7 Sakai株与TW14359株比较:分泌与胞质iTRAQ分析;TW14359 sepD分泌组分析
研究对EHEC O157:H7 Sakai与TW14359的分泌及胞质蛋白进行iTRAQ和LTQ Orbitrap质谱比较,样品经强阳离子交换与HPLC分级。TW14359 sepD分泌组按类似方式制备分析。所有样品均检索TW14359特异性Uniprot蛋白库并加入随机化序列。相关标签含Tw14359、LTQ Orbitrap、EHEC O157:H7、hypersecretion(来源 ebi.ac.uk)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):使用 iTRAQ 和 LTQ Orbitrap 上的质谱技术,对 EHEC O157:H7 Sakai 与 TW14359 的分泌蛋白及胞质蛋白进行比较分析。分析前,样品经强阳离子交换和 HPLC 进行分级分离。对于 TW14359 sepD 分泌组分析,菌株以类似方式制备并分析。所有样品均针对一个与随机化蛋白序列相偶联的 TW14359 特异性蛋白数据库(Uniprot)进行检索。
【主题与分类】
主题标签:Tw14359、Spinach、Ltq orbitrap、Hypersecretion、Ltq。本站分类:感染/胃肠道感染。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000023
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
使用 iTRAQ 和 LTQ Orbitrap 上的质谱技术,对 EHEC O157:H7 Sakai 与 TW14359 的分泌蛋白及胞质蛋白进行比较分析。分析前,样品经强阳离子交换和 HPLC 进行分级分离。对于 TW14359 sepD 分泌组分析,菌株以类似方式制备并分析。所有样品均针对一个与随机化蛋白序列相偶联的 TW14359 特异性蛋白数据库(Uniprot)进行检索。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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