肠出血性大肠杆菌O157:H7 Sakai株与TW14359株比较:分泌与胞质iTRAQ分析;TW14359 sepD分泌组分析

研究对EHEC O157:H7 Sakai与TW14359的分泌及胞质蛋白进行iTRAQ和LTQ Orbitrap质谱比较,样品经强阳离子交换与HPLC分级

pride
2013-09-05 更新
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基因组分类Tw14359SpinachLtq orbitrapHypersecretionLtq
PXD000023: EHEC O157:H7 Sakai vs. TW14359: Secreted and Cytosolic iTRAQ; sepD secretome analysis of TW14359

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2013-09-05

资源简介

肠出血性大肠杆菌O157:H7 Sakai株与TW14359株比较:分泌与胞质iTRAQ分析;TW14359 sepD分泌组分析

研究对EHEC O157:H7 Sakai与TW14359的分泌及胞质蛋白进行iTRAQ和LTQ Orbitrap质谱比较,样品经强阳离子交换与HPLC分级。TW14359 sepD分泌组按类似方式制备分析。所有样品均检索TW14359特异性Uniprot蛋白库并加入随机化序列。相关标签含Tw14359、LTQ Orbitrap、EHEC O157:H7、hypersecretion(来源 ebi.ac.uk)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):使用 iTRAQ 和 LTQ Orbitrap 上的质谱技术,对 EHEC O157:H7 Sakai 与 TW14359 的分泌蛋白及胞质蛋白进行比较分析。分析前,样品经强阳离子交换和 HPLC 进行分级分离。对于 TW14359 sepD 分泌组分析,菌株以类似方式制备并分析。所有样品均针对一个与随机化蛋白序列相偶联的 TW14359 特异性蛋白数据库(Uniprot)进行检索。

【主题与分类】

主题标签:Tw14359、Spinach、Ltq orbitrap、Hypersecretion、Ltq。本站分类:感染/胃肠道感染。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000023

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

使用 iTRAQ 和 LTQ Orbitrap 上的质谱技术,对 EHEC O157:H7 Sakai 与 TW14359 的分泌蛋白及胞质蛋白进行比较分析。分析前,样品经强阳离子交换和 HPLC 进行分级分离。对于 TW14359 sepD 分泌组分析,菌株以类似方式制备并分析。所有样品均针对一个与随机化蛋白序列相偶联的 TW14359 特异性蛋白数据库(Uniprot)进行检索。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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