甲基泼尼松龙对烟曲霉293基因表达的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE46559

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

流行病学上，使用糖皮质激素与侵袭性曲霉病相关。我们发现，生理浓度的氢化可的松和甲泼尼龙（MP）会导致烟曲霉293的生长形态发生变化，表现为核心密度降低、较长菌丝向外生长更直。经MP处理后，与未处理对照相比，我们发现注释为细胞壁结构和细胞周期程序的基因存在差异表达，这或可解释形态学变化。编码毒素、铁获取以及增强氧化应激抗性的细胞壁成分的基因上调，理论上会导致烟曲霉表型更具致病性。参与DNA修复的通路上调可能提示MP的基因毒性效应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。