PRJNA869716：痤疮来源Cutibacterium acnes分离株的分子分型与功能分析揭示皮肤炎症决定因素

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA869716

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数据说明

痤疮皮肤杆菌（C. acnes）是一种普遍存在的皮肤共生细菌，通常能被免疫系统良好耐受。据报道，不同菌株类型的痤疮皮肤杆菌在痤疮患者皮肤上富集。为了解这些菌株类型是否参与皮肤炎症，我们从健康和痤疮受试者的皮肤拭子中构建了包含200多株痤疮皮肤杆菌分离株的菌株库，并评估了其菌株水平的身份和炎症潜能。与皮损部位相比，系统发育型II K型菌株在健康和痤疮非皮损皮肤上更为常见。系统发育型IA-1 C型菌株在痤疮皮损皮肤上占主导地位，但在健康皮肤上不存在。对痤疮皮肤杆菌上清液诱导的宿主细胞因子反应的测定显示，菌株类型和皮肤类型关联均不能预测炎症潜能。然而，相同菌株类型可诱导不同的促炎反应，但这些差异不能归因于蛋白酶、短链脂肪酸或卟啉的产生。相反，全基因组测序揭示高炎症菌株类型中存在一个线性质粒。皮内注射C.

小鼠皮肤中的痤疮丙酸杆菌通过单细胞RNA测序揭示，在真皮成纤维细胞中引发了质粒相关的炎症反应。我们得出结论，痤疮丙酸杆菌的菌株类型不足以预测炎症，但包括质粒在内的其他毒力因子可能促进疾病发生。总体设计：对皮内感染痤疮丙酸杆菌的小鼠皮肤活检样本进行单细胞RNA测序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。