DILfrequency 临床试验样本的单细胞多组学分析
该数据集来自 NCBI BioProject(编号 PRJNA830341),围绕 DILfrequency 临床试验样本开展单细胞多组学分析,主题标签为转录组或基因表达,本站归类于免疫系统疾病及其他

基本信息
资源简介
DILfrequency 临床试验样本的单细胞多组学分析
PRJNA830341 是一个围绕 DILfrequency 临床试验样本开展单细胞多组学分析的数据集,收录于 NCBI BioProject,编号为 PRJNA830341。该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,即转录组或基因表达,本站将其归类于免疫系统疾病及其他。从整体定位来看,它属于生物项目(BioProject)体系下的数据集合,旨在为与单一研究计划相关的多种生物数据提供统一的查找入口。该项目聚焦于临床试验样本的单细胞多组学层面,因而在数据类型上具有多组学整合的特征,在研究对象上则与免疫系统疾病相关。对于关注单细胞水平基因表达、转录组分析以及临床试验样本研究的用户而言,该数据集提供了一个可定位、可追溯的数据资源入口。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject,编号为 PRJNA830341,其英文名称为“PRJNA830341: Single-cell multi-omics analyses in the DILfrequency clinical trail samples”。从名称可以看出,该项目与 DILfrequency 临床试验样本相关,研究内容为单细胞多组学分析。BioProject 作为生物数据的集合,通常源自单一组织或联盟的某一项研究计划,并为用户提供查找该项目所生成的不同数据类型链接的统一位置。本站将该数据集归类于免疫系统疾病及其他,主题标签为转录组或基因表达,说明其数据内容与基因表达、转录组层面密切相关,并可能涉及免疫系统疾病相关的研究背景。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其数据内容主要围绕转录组或基因表达展开。结合数据集名称中的“Single-cell multi-omics analyses”,可以确认该项目涉及单细胞多组学分析。不过,关于具体的组学类型组合、细胞数量、样本数量、测序平台、数据文件格式等细节,源站未提供。本站分类为免疫系统疾病及其他,提示该数据集在应用领域上与免疫系统疾病相关,但具体涉及哪些疾病亚型或临床指标,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,收录于 NCBI BioProject,编号 PRJNA830341。其英文名称中提及“DILfrequency clinical trail samples”,说明样本与 DILfrequency 临床试验相关。BioProject 记录本身提供用户查找该项目所生成的不同数据类型的链接。关于样本采集的具体时间、地点、受试者信息、伦理审批信息以及临床试验的具体设计,源站未提供。
【适用场景】
基于主题标签“Transcriptome or Gene expression”以及单细胞多组学分析的研究定位,该数据集适用于与转录组、基因表达相关的分析场景,尤其是需要在单细胞水平上探索基因表达特征的研究。同时,由于本站将其归类于免疫系统疾病及其他,该数据集也可能适用于免疫系统疾病相关的研究背景。关于该数据集是否适用于特定疾病亚型、特定治疗响应分析或特定临床终点研究,源站未提供。
【使用方法】
该数据集收录于 NCBI BioProject,用户可通过 BioProject 记录查找该项目所生成的不同数据类型链接。BioProject 的设计目的正是为用户提供一个统一的位置,以便找到与单一研究计划相关的多样化数据。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程或配套工具,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject,属于生物数据集合。关于数据质量评估指标、数据完整性、批次效应、技术偏差或验证情况,源站未提供。此外,该数据集与 DILfrequency 临床试验样本相关,但关于样本量、数据覆盖度以及是否包含对照样本等信息,源站未提供。使用者在解释和利用该数据集时,应结合源站记录自行核实相关细节。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI BioProject,编号为 PRJNA830341。关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制或数据共享政策,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA830341
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
尽管低剂量白细胞介素-2(LD-IL-2)免疫疗法在临床上早期取得了成功,但其作用机制仍仅被部分了解。本数据集源自DILfrequency临床试验样本,旨在通过高分辨率单细胞多组学技术,探究间隔给药低剂量重组IL-2(iLD-IL-2)的效果。总体设计:招募了13名成年1型糖尿病患者,并每三天接受一次重组IL-2治疗,持续30天。每位参与者在第0天、第27天和第55天分别采集三次纵向血液样本。通过荧光激活细胞分选(FACS)从每个样本中分离出选定的免疫细胞亚群,并使用定制mRNA和AbSeq面板在BD Rhapsody单细胞测序平台上进行分析。手稿中所有与COVID-19相关的结论均基于先前发表的数据与当前数据集的比较,而当前数据集本身并不包含COVID-19患者。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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