PRJNA511891：治疗过程中痤疮复发患者外周血基因表达差异研究

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA511891

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的：识别痤疮暴发患者的基因表达变化，从而探讨治疗后痤疮暴发的机制。方法：将11例痤疮患者和3例健康人分为4组（第1组：4例暴发，第2组：4例改善，第3组：3例无明显变化，第4组：健康对照）。收集患者在接受异维A酸或米诺环素治疗前后的外周血。采用RNA-seq检测基因表达。我们将数据应用于自身对照和组间比较。结果：在第1组的自身对照中，22个上调基因参与Toll样受体信号通路和炎症反应。比较治疗前第1组和第3组，1778个上调基因富集于Th17细胞分化，而57个下调基因富集于对生物体的防御反应。结论：痤疮暴发患者的基因表达谱发生了变化。炎症、免疫反应在痤疮暴发过程中发挥突出作用，而对微生物的防御反应相对较弱，粉刺形成可能是危险因素。

总体设计：采用RNA-seq检测痤疮暴发患者和健康对照者的基因表达。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。