PRJNA422460：长效免疫应答包括浆细胞及皮脂腺改变导致痤疮患者萎缩性瘢痕形成
该数据集来自 NCBI，包含对易留瘢痕（SP）与非易留瘢痕（NSP）痤疮患者未受累皮肤及 48 小时和 3 周龄痤疮丘疹的大规模基因表达谱分析，并用免疫组织化学在蛋白和细胞水平验证转录组结果
基本信息
资源简介
PRJNA422460：长效免疫应答包括浆细胞及皮脂腺改变导致痤疮患者萎缩性瘢痕形成
PRJNA422460 数据集聚焦于痤疮患者萎缩性瘢痕形成的病理生理机制，来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），主题标签为转录组或基因表达。该数据集收录了对易留瘢痕（scar-prone，SP）与非易留瘢痕（non-scar-prone，NSP）痤疮患者未受累皮肤以及 48 小时龄和 3 周龄痤疮丘疹进行的大规模基因表达谱分析，并应用免疫组织化学技术在蛋白和细胞水平对转录组结果加以验证。研究旨在识别与萎缩性痤疮瘢痕形成相关的分子与细胞通路，为预防痤疮瘢痕的新疗法提供线索。在本站分类中，该数据集归入免疫系统疾病 / 其他类别。
【数据集背景】
痤疮病灶的可能结局之一是萎缩性瘢痕，这类瘢痕可能给患者带来严重的生理与心理困扰。目前针对痤疮后瘢痕的治疗仍然困难，且往往需要侵入性操作。既往关于痤疮瘢痕的病理生理研究仅考察了丘疹生命周期的第一周。该数据集对应的研究即以此为背景，旨在研究萎缩性痤疮瘢痕形成的病理生理机制，以识别能够促成预防痤疮瘢痕新疗法的分子和细胞通路。
【数据内容】
该数据集包含大规模基因表达谱数据，覆盖两类人群（易留瘢痕患者与不易留瘢痕患者）和三类皮肤样本状态：未受累的痤疮皮肤、48 小时龄痤疮丘疹以及 3 周龄痤疮丘疹。除转录组数据外，研究还采用免疫组织化学技术，在蛋白和细胞水平对转录组结果进行确认。数据主题标签为转录组或基因表达。源站描述在结果部分提及基因表达与免疫组织化学分析显示出非常相似的结果，但该句在源站描述中未完整呈现，后续内容源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），数据集英文名称为“PRJNA422460: Long-acting immune responses including plasma cells and alteration of sebaceous glands cause atrophic scar formation in acne patients”。研究对易留瘢痕（SP）与不易留瘢痕（NSP）痤疮患者的未受累皮肤及 48 小时龄、3 周龄痤疮丘疹分别开展大规模基因表达谱分析，并以免疫组织化学技术进行蛋白与细胞水平的验证。样本量、采集部位细节、测序平台与具体实验流程等信息源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息，该数据集适用于痤疮瘢痕形成机制相关的研究场景，尤其是围绕萎缩性痤疮瘢痕的病理生理探索：可用于比较易留瘢痕与不易留瘢痕患者在未受累皮肤及不同龄期痤疮丘疹之间的基因表达差异，识别与瘢痕形成相关的分子与细胞通路；也可作为转录组结果与蛋白、细胞水平验证相结合的研究素材，服务于预防痤疮瘢痕新疗法靶点的发现与后续验证。具体分析用途的细节源站未提供。
【使用方法】
源站未提供。
【质量与限制】
源站描述中结果部分仅呈现到“基因表达与免疫组织化学分析显示出非常相似”即中断，完整结论、样本规模、统计方法及验证细节均源站未提供。数据集仅覆盖 48 小时龄与 3 周龄两个丘疹时间点及未受累皮肤，其他时间点或组织类型是否包含源站未提供。使用时应以源站记录为准。
【引用与许可】
源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA422460
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
背景：痤疮皮损的可能结局是萎缩性瘢痕，这可能会造成严重的身心困扰。目前痤疮后瘢痕的治疗仍然困难，且往往需要侵入性操作。关于痤疮瘢痕的病理生理学研究仅调查了丘疹形成后的第一周。目的：研究萎缩性痤疮瘢痕形成的病理生理学，以确定可促成预防痤疮瘢痕新疗法的分子和细胞通路。方法：对48小时和3周龄的未受累痤疮皮肤及痤疮丘疹分别进行大规模基因表达谱分析，研究对象包括瘢痕易感（SP）和非瘢痕易感（NSP）患者。应用免疫组织化学技术在蛋白质和细胞水平上证实转录组学结果。结果：基因表达和免疫组织化学分析显示，SP和NSP人群中48小时龄丘疹的免疫反应非常相似，其特征为T细胞、中性粒细胞和巨噬细胞数量升高。然而，仅在SP患者中，免疫反应在3周龄丘疹中持续存在，并以重要的B细胞浸润为特征。
在NSP患者中，48小时龄的丘疹内观察到脂质代谢相关基因的短暂下调，随后3周后基因表达水平恢复正常。相反，在SP患者中，3周龄的丘疹内观察到脂质代谢酶急剧减少，提示不可逆的改变。受影响的脂质代谢基因被发现优先在人皮脂腺中表达，指向SP痤疮患者在3周炎症重塑后皮脂腺结构的破坏。总体设计：共54张芯片。18名非瘢痕倾向和瘢痕倾向患者：每名患者3次活检：1次非病变皮肤（背部），1次小于48小时龄的丘疹（背部），1次21天龄丘疹皮肤（背部）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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