基本信息

模态

基因组

任务类型

回归

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA395011：额部纤维性脱发的组织与循环 microRNA 共表达分析 [皮肤]

该数据集为 NCBI BioProject 收录的人类额部纤维性脱发相关研究项目，英文全称为 PRJNA395011: Tissue and circulating microRNA co-expression analysis reveals potential involvement of miRNAs in the pathobiology of frontal fibrosing alopecia [skin]。项目以 Homo sapiens 为研究对象，围绕额部纤维性脱发这一疾病，采用组织与循环 microRNA 共表达分析策略，探索 miRNA 在该疾病病理生物学中的潜在作用。数据主题归类为转录组或基因表达，本站将其归入免疫系统疾病及其他类别。项目来源为 ncbi.nlm.nih.gov，用户可通过该 BioProject 记录集中获取与该项目相关的多种数据类型链接。

【数据集背景】

额部纤维性脱发是一种与免疫系统相关的疾病，其病理生物学机制尚待深入阐明。该数据集所对应的研究项目旨在从转录后调控层面切入，通过比较组织与循环中的 microRNA 表达特征，寻找可能参与疾病发生发展的 miRNA 分子。项目以 Homo sapiens 为研究对象，属于转录组或基因表达范畴，本站分类将其置于免疫系统疾病及其他类别之下。该研究的设计思路强调组织与循环样本之间的共表达关系，而非仅关注单一来源的 miRNA 变化，这一策略有助于揭示 miRNA 在局部病变与全身循环之间的潜在联系。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其核心数据为基因表达相关数据，具体涉及 microRNA 的表达信息。项目名称明确指向组织与循环 microRNA 的共表达分析，因此数据内容应涵盖来自组织样本与循环样本的 microRNA 表达谱，以及在此基础上开展的共表达分析结果。源站描述指出，BioProject 记录本身是一个集中入口，用于链接该项目所产生的多种数据类型。关于样本数量、测序平台、具体 miRNA 种类、表达量数值及分析结果等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库，项目 ID 为 395011。BioProject 是围绕单一研究计划或联盟收集生物数据的集合，其记录为用户提供查找该项目所生成各类数据的统一入口。本项目由单一组织或联盟发起，具体发起机构名称、样本采集地点、采集时间、伦理审批信息及供体特征等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与额部纤维性脱发病理生物学相关的研究场景，尤其是关注 microRNA 调控机制、组织与循环 miRNA 共表达关系以及免疫系统疾病分子特征的分析工作。研究人员可利用该 BioProject 记录定位并获取项目产生的转录组或基因表达数据，用于探索 miRNA 在疾病中的潜在功能。此外，该数据集也可作为免疫系统疾病及其他类别下基因表达数据整合分析的参考来源之一。关于具体的分析流程、统计方法或验证实验设计，源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录访问该数据集，并借助记录中提供的链接获取项目所生成的不同类型数据。由于 BioProject 本身是数据集合的入口，实际数据的使用需遵循各链接所指向数据库的相应规范。关于数据下载格式、预处理步骤、标准化方法及分析工具等操作细节，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公共数据库收录的研究项目记录。其数据质量、样本代表性、测序深度、覆盖度及分析可靠性等具体指标，源站未提供。此外，该研究聚焦于 Homo sapiens 的额部纤维性脱发，结论的外推需考虑物种与疾病特异性。关于数据是否存在批次效应、技术偏差或验证不足等限制，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、许可协议、使用条款及数据共享政策等，源站未提供。用户在使用时应参考 NCBI BioProject 及项目相关数据库的通用引用规范与许可要求。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE101619

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA395011

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

额部纤维性脱发（FFA）是毛囊性扁平苔藓的一种临床变异型，主要发生于绝经后女性，是一种免疫介导的炎症性原发性淋巴细胞性瘢痕性脱发。FFA主要累及头皮、面部毛发和眉毛，但也影响其他身体区域。微小RNA（miRNA）已成为慢性炎症性、纤维化和自身免疫性疾病中具有病理生物学、诊断和治疗意义的潜在候选分子。为探索miRNA在FFA中的疾病相关性，我们从10例经活检证实、未经治疗的FFA病例和10例匹配对照者的静脉血中分离血浆，并使用人类纤维化miRNA PCR阵列（Qiagen）进行miRNA表达分析。另选取7例活动性FFA病例和7例匹配的健康对照者进行组织microRNA分析，所有14份头皮活检提取的microRNA样本均在Affymetrix GeneChip miRNA 4.0阵列上进行微阵列分析。我们为两个皮肤组织网络（病例组和对照组）生成了一系列群落，并确定了聚类中心（ exemplars）作为每个群落的代表性miRNA。

在对照网络中，有20个示例在血浆（对照）数据集中显著富集，而FFA中有27个。其中，两个网络中共有的miRNA有17个，其中9个在FFA疾病表型中具有代表性。随机森林分析表明，4种循环miRNA（hsa-let-7d-5p、hsa-miR-18a-5p、has-miR-20a-5p和hsa-miR-19a-3p）能够区分FFA和对照组。我们对皮肤和血浆miRNA共表达的研究突出了具有潜在预测价值的循环miRNA作为生物标志物，这些标志物现在应在更大的队列中进行验证。总体设计：使用Affymetrix GeneChip miRNA 4.0阵列对FFA患者和健康对照者皮肤中的miRNA进行表达谱分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别