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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA395010：组织和循环microRNA共表达分析揭示miRNA可能参与额部纤维性脱发的病理生物学 [血液]

PRJNA395010 是一个围绕人类额部纤维性脱发（frontal fibrosing alopecia）相关 microRNA 研究而建立的生物学数据集合，其完整英文名称为“Tissue and circulating microRNA co-expression analysis reveals potential involvement of miRNAs in the pathobiology of frontal fibrosing alopecia [blood]”。该数据集归属于免疫系统疾病 / 其他这一分类，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。从标题可以看出，该项目关注组织与循环 microRNA 的共表达分析，并探索 miRNA 在额部纤维性脱发病理生物学中的潜在作用，样本类型涉及血液。作为 BioProject 记录，它为用户提供了一个统一入口，用以查找围绕该单一研究计划所产生的多种数据类型及其链接。

【数据集背景】

该数据集源自 NCBI 的 BioProject 体系。BioProject 是围绕单一计划、来自单一机构或联盟的生物学数据集合。BioProject 记录为用户提供一个统一位置，以查找为该项目产生的多种数据类型所对应的链接。本项目的英文名称明确指向额部纤维性脱发相关的 microRNA 研究，具体为组织与循环 microRNA 的共表达分析，并标注了血液样本。其分类落在免疫系统疾病 / 其他之下，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，说明该项目主要涉及转录组或基因表达层面的数据。

【数据内容】

依据现有信息，该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其内容与转录组或基因表达相关。项目标题提及组织与循环 microRNA 的共表达分析，并涉及血液样本。除这些指向性信息外，关于具体样本数量、测序平台、数据文件格式、表达矩阵或差异分析结果等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 的 BioProject 记录，项目编号为 PRJNA395010，对应 Homo sapiens（ID 395010）。项目标题中标注了 [blood]，提示血液样本是该研究的一部分。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息、受试者纳入排除标准以及机构或联盟名称，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与额部纤维性脱发病理生物学相关的 microRNA 研究，尤其是组织与循环 microRNA 的共表达分析。其主题标签 Transcriptome or Gene expression 表明，它可用于转录组或基因表达层面的探索。由于分类为免疫系统疾病 / 其他，也可能服务于免疫系统疾病相关的基础或转化研究。关于具体的分析流程、推荐工具或下游应用案例，源站未提供。

【使用方法】

BioProject 记录为用户提供一个统一位置，以查找为该项目产生的多种数据类型所对应的链接。因此，使用者可通过该记录定位并访问与 PRJNA395010 相关的数据资源。关于数据下载方式、文件组织格式、访问权限或分析软件要求，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 BioProject 记录，其描述强调 BioProject 是围绕单一计划、来自单一机构或联盟的生物学数据集合，并提供统一查找入口。关于数据质量指标、测序深度、覆盖度、批次效应、样本量或验证实验等信息，源站未提供。使用者应注意，现有信息不足以评估该数据集的具体质量水平或技术限制。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 PRJNA395010。关于引用格式、许可条款、使用限制或数据共享政策，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE101618

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA395010

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

额部纤维性脱发（FFA）是毛囊性扁平苔藓的一种临床变异型，主要发生于绝经后女性，是一种免疫介导的炎症性原发性淋巴细胞性瘢痕性脱发。FFA主要累及头皮、面部毛发和眉毛，但也影响其他身体区域。微小RNA（miRNA）已成为慢性炎症性、纤维化和自身免疫性疾病中具有病理生物学、诊断和治疗意义的潜在候选分子。为探索miRNA在FFA中的疾病相关性，我们从10例经活检证实、未经治疗的FFA病例和10例匹配对照者的静脉血中分离血浆，并使用人类纤维化miRNA PCR阵列（Qiagen）进行miRNA表达分析。另选取7例活动性FFA病例和7例匹配的健康对照者进行组织microRNA分析，所有14份头皮活检提取的microRNA样本均在Affymetrix GeneChip miRNA 4.0阵列上进行微阵列分析。我们为两个皮肤组织网络（病例组和对照组）生成了一系列群落，并确定了聚类中心（ exemplars）作为每个群落的代表性miRNA。

在对照网络中，有20个示例在血浆（对照）数据集中显著富集，而FFA中则有27个。其中，两个网络共有的miRNA有17个，其中9个在FFA疾病表型中具有代表性。随机森林分析表明，4种循环miRNA（hsa-let-7d-5p、hsa-miR-18a-5p、has-miR-20a-5p和hsa-miR-19a-3p）能够区分FFA与对照组。我们对皮肤和血浆miRNA共表达的研究突显了具有潜在预测价值的循环miRNA作为生物标志物，这些标志物现在应在更大的队列中进行验证。总体设计：对健康对照组或FFA患者血浆中的miRNA进行RT-PCR检测。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别