PRJNA389770：EZH2/1组蛋白甲基转移酶抑制剂诱导强效抗病毒状态并抑制多种病毒病原体感染[RNA-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA389770

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

表观遗传调控基于一个复合物网络，该网络调节基因组的染色质特征和结构，从而影响基因表达、细胞命运和发育。因此，表观遗传调节因子代表了一类治疗包括恶性肿瘤在内的多种疾病的新型治疗靶点。疱疹病毒等感染性病原体也受细胞表观遗传机制的调控，表观遗传疗法代表了一种控制感染、潜伏持续及由此导致的复发疾病的新方法。组蛋白甲基转移酶EZH2和EZH1（EZH2/1）是表观遗传抑制因子，通过扩散富含抑制性H3K27me3的染色质结构域来抑制基因转录。然而，尽管EZH2/1被认为参与抑制疱疹病毒基因表达，但这些酶的抑制剂在体外和体内均抑制了HSV原发感染。此外，这些化合物在潜伏感染的感觉神经节中诱导HSV再激活后阻断了裂解性病毒复制。这种抑制作用与多条炎症、应激和抗病原体通路的诱导以及免疫细胞向体内感染部位募集的增强相关。

重要的是，EZH2/1抑制剂诱导了一种细胞抗病毒状态，该状态还能抑制DNA病毒（hCMV、腺病毒）和RNA病毒（寨卡病毒）的感染。因此，EZH2/1抑制剂通过激活细胞抗病毒和免疫反应，具有作为广谱抗病毒药物的相当大的潜力。总体设计：该数据集包括人包皮成纤维细胞（HFF）和小鼠三叉神经节的基因表达谱分析。HFF细胞用GSK126（30 µM）或溶剂对照处理1小时、2小时和5小时，设生物学三重复。来自模拟感染或HSV-1潜伏感染的BALB/c小鼠的三叉神经节，在含有GSK126（30 µM）或溶剂对照的培养基中培养12小时，设生物学三重复（每个重复合并4-5个三叉神经节）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。