大鼠咽鼓管单细胞转录组图谱揭示基质Anxa1-中性粒细胞Fpr2轴抑制分泌性中耳炎Nlrp3炎症小体活性
该数据集为大鼠咽鼓管单细胞转录组图谱，属于免疫系统疾病领域的转录组或基因表达数据。研究聚焦分泌性中耳炎，通过单细胞转录组揭示基质Anxa1与中性粒细胞Fpr2构成的信号轴对Nlrp3炎症小体活性的抑制作用
基本信息
资源简介
大鼠咽鼓管单细胞转录组图谱揭示基质Anxa1-中性粒细胞Fpr2轴抑制分泌性中耳炎Nlrp3炎症小体活性
该数据集为大鼠咽鼓管单细胞转录组图谱，属于免疫系统疾病领域的转录组或基因表达数据。研究聚焦分泌性中耳炎，通过单细胞转录组揭示基质Anxa1与中性粒细胞Fpr2构成的信号轴对Nlrp3炎症小体活性的抑制作用。数据集英文名称为“PRJNA1498503: Single-cell transcriptomic landscape of the rat Eustachian tube reveals a stromal Anxa1-neutrophil Fpr2 axis restraining Nlrp3 inflammasome activity in otitis media with effusion”，源站标题为“Single-cell transcriptomic landscape of the rat Eu... (ID 1498503) - BioProject - NCBI”，来源站为ncbi.nlm.nih.gov，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，本站分类归入免疫系统疾病 / 其他。整体而言，该数据集围绕大鼠咽鼓管这一解剖部位，以单细胞分辨率刻画其转录组景观，并将分泌性中耳炎作为疾病背景，探讨基质细胞与中性粒细胞之间通过Anxa1-Fpr2信号轴对Nlrp3炎症小体活性的调控关系。
【数据集背景】
该数据集来源于NCBI BioProject，编号为1498503，英文名称明确指向大鼠咽鼓管单细胞转录组景观的研究。其研究背景落在免疫系统疾病范畴，具体疾病为分泌性中耳炎（otitis media with effusion）。从标题所反映的科学问题来看，研究关注咽鼓管局部微环境中基质细胞与免疫细胞之间的相互作用，尤其是基质来源的Anxa1与中性粒细胞表面Fpr2所构成的信号轴，以及该信号轴对Nlrp3炎症小体活性的抑制效应。主题标签“Transcriptome or Gene expression”表明该项目的核心数据类型属于转录组或基因表达层面。本站将其分类为免疫系统疾病 / 其他，说明其在疾病分类体系中主要关联免疫相关疾病，同时可能涉及其他交叉方向。
【数据内容】
依据源站描述，BioProject是一组与单一研究计划相关的生物学数据集合，来源于单一组织或联盟，并为用户提供单一入口以查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其数据内容属于转录组或基因表达类型。结合数据集英文名称，该数据内容应为大鼠咽鼓管组织的单细胞转录组图谱，用于刻画该组织的细胞组成与基因表达特征，并在此基础上分析分泌性中耳炎中基质Anxa1-中性粒细胞Fpr2轴与Nlrp3炎症小体活性之间的关系。除上述信息外，关于具体样本数量、细胞数、测序平台、数据文件格式等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为ncbi.nlm.nih.gov，源站标题显示其归属于BioProject数据库，项目ID为1498503。源站描述指出，BioProject记录来自单一组织或联盟，围绕单一研究计划汇集相关生物学数据，并提供链接以访问该项目产生的多种数据类型。该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，本站分类为免疫系统疾病 / 其他。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息、实验动物品系、造模方法、测序机构等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于免疫系统疾病领域中与分泌性中耳炎相关的研究场景，尤其是需要在单细胞水平上理解咽鼓管组织细胞异质性、基质细胞与中性粒细胞互作、以及Anxa1-Fpr2信号轴对Nlrp3炎症小体调控机制的研究。主题标签“Transcriptome or Gene expression”表明其可用于转录组或基因表达分析，例如细胞类型鉴定、差异表达分析、细胞间通讯推断以及炎症相关通路研究。由于本站分类为免疫系统疾病 / 其他，该数据集也可能为交叉学科研究提供参考。关于具体分析工具、参考基因组版本、标准化流程等，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以BioProject记录形式提供，用户可通过来源站ncbi.nlm.nih.gov访问项目ID 1498503，并借助BioProject提供的链接查找该项目产生的多种数据类型。源站描述强调BioProject为用户提供单一入口以定位相关数据。关于数据下载方式、文件格式、是否需申请权限、是否提供原始测序数据或处理后表达矩阵等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于NCBI BioProject，属于公共数据库记录，其源站描述仅说明BioProject的通用性质，未提供该项目的具体质量控制指标、测序深度、细胞过滤标准、批次效应处理等信息。主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，本站分类为免疫系统疾病 / 其他。关于样本量、重复数、验证实验、数据完整性等质量相关细节，源站未提供。因此，使用该数据集时需注意其具体质量与限制信息在现有来源中尚不明确。
【引用与许可】
该数据集的来源站为ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Single-cell transcriptomic landscape of the rat Eu... (ID 1498503) - BioProject - NCBI”。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、是否允许再分发或商业使用等信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1498503
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
分泌性中耳炎（OME）是一种常见的中耳和咽鼓管黏膜炎症性疾病。利用大鼠咽鼓管组织的单细胞RNA测序，我们绘制了OME大鼠模型中的早期免疫和基质细胞图谱，并鉴定出一条与疾病相关的Anxa1-Fpr2配体-受体轴，其中基质来源的Anxa1与浸润中性粒细胞上的Fpr2结合，从而抑制Nlrp3炎症小体通路活性。该数据集包含两个混合样本（Sham和OME），每个样本均由六只大鼠的咽鼓管组织混合制备而成。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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