伴鼻息肉的慢性鼻窦炎转录组分析

该数据集来自 NCBI BioProject(编号 1494473),主题为伴鼻息肉的慢性鼻窦炎的转录组分析,属于免疫系统疾病相关数据

sra
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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA1494473: Transcriptomic profiling of chronic rhinosinusitis with nasal polyps

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

伴鼻息肉的慢性鼻窦炎转录组分析

PRJNA1494473 是一个来自 NCBI BioProject 数据库的转录组学数据集,其完整英文名称为“Transcriptomic profiling of chronic rhinosinusitis with nasal polyps”,即伴鼻息肉的慢性鼻窦炎的转录组分析。该数据集在 BioProject 中的编号为 1494473,主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其核心数据为基因表达层面的转录组信息。按照本站分类,该数据集归属于免疫系统疾病 / 其他类别,提示其与免疫系统相关疾病的研究有关。BioProject 作为 NCBI 提供的项目集合,旨在将同一项研究计划所产生的多种类型生物数据集中收录,使用户能够通过单一记录入口获取该项目关联的各类数据资源。该数据集围绕伴鼻息肉的慢性鼻窦炎这一疾病展开转录组层面的分析,为相关研究提供了基因表达数据的基础。

【数据集背景】

伴鼻息肉的慢性鼻窦炎是一种与免疫系统相关的疾病,其病理机制涉及鼻腔和鼻窦黏膜的慢性炎症过程。该数据集以转录组分析为核心手段,旨在从基因表达层面刻画这一疾病的分子特征。数据集的英文名称明确指向“chronic rhinosinusitis with nasal polyps”的转录组分析,说明其研究背景聚焦于该疾病的转录组学层面。作为 NCBI BioProject 体系中的一个项目记录,该数据集遵循 BioProject 的组织方式,将同一研究计划下产生的生物数据汇聚在一起,便于研究者查找和关联不同数据类型。本站将其归类为免疫系统疾病 / 其他,进一步说明其在疾病分类体系中的位置。该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI 所维护的公共生物数据资源体系。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。数据集名称中的“Transcriptomic profiling”也直接说明其内容为转录组层面的表达谱分析。BioProject 记录本身并不限定单一数据类型,而是作为项目集合,提供指向该项目所生成各类数据的链接入口。因此,该数据集所涵盖的具体数据文件、样本数量、表达矩阵或测序读长等信息,源站未提供。可以明确的是,该数据集围绕伴鼻息肉的慢性鼻窦炎展开转录组分析,其数据内容与基因表达相关,属于转录组学数据范畴。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,具体收录于 NCBI BioProject 数据库,项目编号为 1494473。BioProject 是由单一组织或联盟发起的、与某一研究计划相关的生物数据集合,其记录为用户提供查找该项目所生成多种数据类型链接的统一入口。该数据集即属于此类项目记录,其数据来源于 NCBI BioProject 体系。关于样本采集的具体地点、时间、人群信息、测序平台或实验流程等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与伴鼻息肉的慢性鼻窦炎相关的转录组学研究,可用于探索该疾病在基因表达层面的特征。由于主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,其典型应用场景包括基因表达差异分析、转录组数据挖掘以及免疫系统疾病相关分子机制的研究。本站分类将其归入免疫系统疾病 / 其他,提示其可服务于免疫系统疾病领域的生物信息学分析。此外,作为 BioProject 记录,该数据集也可用于关联同一项目下的其他数据类型,支持多组学整合研究的检索与发现。具体适用的分析流程或研究设计,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库访问,项目编号为 1494473。用户可在 NCBI 网站中检索该编号或数据集英文名称,进入对应的 BioProject 记录页面,进而获取该项目所关联的数据链接。BioProject 记录的设计目的即在于为用户提供单一入口,以查找该项目生成的多种数据类型。关于数据下载的具体格式、文件组织方式或分析工具的使用说明,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公共生物数据资源体系中的项目记录。BioProject 作为项目集合,其记录本身提供的是数据链接入口,而非对数据质量的直接评价。关于该数据集的数据质量指标、样本量、测序深度、覆盖度或潜在偏差等信息,源站未提供。此外,该数据集的具体数据内容、实验设计细节以及数据完整性等,源站未提供。使用者应结合源站记录中的实际数据链接自行评估数据适用性。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 数据库记录。关于该数据集的引用方式、许可条款或使用限制,源站未提供。使用者在使用该数据集时,应参考 NCBI BioProject 记录页面中可能提供的引用指南和许可信息。由于源站未提供具体的引用格式与许可声明,建议用户直接访问该 BioProject 记录以获取相关说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1494473

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

伴鼻息肉的慢性鼻窦炎(CRSwNP)是一种异质性炎症性疾病,其特征为多样的免疫反应和分子内型。本研究对22例受试者的鼻黏膜组织进行了批量RNA测序,包括8例健康对照、9例嗜酸性CRSwNP(eCRSwNP)和5例非嗜酸性CRSwNP(neCRSwNP)患者。通过转录组分析以表征炎症特征。该数据集为研究CRSwNP的炎症异质性提供了转录组资源。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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