基本信息

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基因组

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1473609：对照组与VL感染BALB/c小鼠基于性别的miRNA表达谱

PRJNA1473609 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库中的生物项目，其英文全称为“Gender-based miRNA expression profiling in control versus VL-infected BALB/c mice”。该项目围绕 BALB/c 小鼠展开，比较对照组与 VL 感染组之间基于性别的 miRNA 表达谱差异。从主题标签来看，该项目属于转录组或基因表达范畴，本站将其归入免疫系统疾病 / 其他分类。项目以 BioProject 形式组织，旨在为与单一研究计划相关的多种生物数据类型提供统一的检索入口，便于用户集中获取该项目所产生的数据资源。整体而言，该数据集聚焦于宿主 miRNA 表达在感染背景下的性别差异，属于免疫相关转录调控研究的数据集合。

【数据集背景】

该数据集的源站标题为“Mus musculus strain:BALB/c (ID 1473609) - BioProject - NCBI”，表明其研究对象为 BALB/c 品系的小鼠。BALB/c 是一种常用的近交系实验小鼠，广泛用于免疫学与感染相关研究。项目英文名称明确指出研究关注的是“control versus VL-infected”两组之间的比较，即对照组与 VL 感染组。VL 通常指内脏利什曼病（Visceral Leishmaniasis），但源站未提供该缩写的具体展开说明。项目同时强调“Gender-based”，说明其分析维度涉及性别因素。本站将该数据集归类于免疫系统疾病 / 其他，与其感染免疫的研究背景相符。源站未提供该项目的具体研究机构、资助来源或所属联盟信息。

【数据内容】

依据主题标签，该数据集的内容属于“Transcriptome or Gene expression”，即转录组或基因表达数据。项目名称表明所涉及的具体数据类型为 miRNA 表达谱。研究比较的是对照组与 VL 感染组 BALB/c 小鼠之间的 miRNA 表达差异，并在此基础上引入性别维度。因此，数据内容应涵盖不同性别、不同感染状态下小鼠样本的 miRNA 表达信息。源站未提供样本数量、测序平台、表达矩阵的具体格式、差异表达 miRNA 的数量或具体名称等细节。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 PRJNA1473609。BioProject 作为生物数据的集合性记录，来源于单一组织或联盟，并为用户提供查找该项目所生成的不同数据类型链接的统一入口。源站未提供样本采集的具体时间、地点、实验操作流程、测序深度或原始数据文件的具体信息。

【适用场景】

该数据集适用于转录组与基因表达相关的研究场景，尤其是涉及 miRNA 表达分析的工作。由于项目聚焦于 BALB/c 小鼠在 VL 感染与对照条件下的性别差异，其潜在适用方向包括感染免疫学、宿主 miRNA 调控机制、性别差异对免疫应答的影响等研究领域。此外，该数据集也可作为免疫系统疾病相关转录组研究的参考数据。源站未提供该数据集在具体研究中的验证结果或应用案例。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库，以项目编号 PRJNA1473609 检索并访问该项目的记录页面。BioProject 记录提供指向该项目所生成的不同数据类型的链接，用户可据此进一步获取相关数据。源站未提供具体的数据下载格式、分析流程、软件工具或使用协议等技术细节。

【质量与限制】

该数据集以 BioProject 形式组织，其记录本身是项目层面的元数据集合，而非直接的分析结果。源站未提供关于数据质量评估、样本量、批次效应、测序质量或统计方法的信息。此外，源站未提供该项目的完整描述、实验设计细节或数据完整性说明。因此，在使用该数据集时，需注意其信息范围仅限于项目记录层面，具体数据质量需结合原始数据进一步判断。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、许可协议或使用条款信息。用户在使用时应参考 NCBI BioProject 数据库的相关政策以及项目记录页面所附的说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1473609

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1473609

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究探讨了BALB/c小鼠在内脏利什曼病（VL）感染期间，基于性别的miRNA表达谱差异。对收集自雄性和雌性BALB/c小鼠的样本进行了小RNA测序，样本涵盖两种条件：未感染的对照组和感染了引起VL的利什曼原虫的种类。本研究旨在识别性别特异性的宿主miRNA表达模式，这些模式可能是雄性和雌性之间免疫反应及疾病结局差异的基础。该数据集包含了每组生物学重复小鼠脾脏的原始miRNA测序读数。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别