基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

TAFRO综合征患者加用西罗莫司治疗前后外周血单细胞RNA测序

该数据集是一项针对TAFRO综合征患者的单细胞RNA测序研究，聚焦于患者在接受加用西罗莫司治疗前后的外周血样本。通过采集治疗前后两个时间点的外周血，研究者可以比较外周血细胞在转录组和基因表达层面的变化特征。数据集以BioProject形式组织，编号为PRJNA1459315，属于免疫系统疾病相关分类，主题标签为转录组或基因表达。该资源为探索TAFRO综合征在特定治疗干预下的分子响应提供了单细胞层面的数据基础，适用于免疫细胞亚群组成、基因表达差异以及治疗相关转录变化等方向的分析。

【数据集背景】

TAFRO综合征是一种与免疫系统相关的疾病，其临床与分子特征受到关注。该数据集来源于一项单细胞RNA测序研究，旨在观察患者在接受加用西罗莫司治疗前后外周血的转录组变化。西罗莫司作为一种免疫抑制类药物，其加用治疗可能对患者外周血免疫细胞的状态产生影响。通过单细胞水平的测序，可以在细胞亚群分辨率下考察治疗前后的基因表达差异，从而为理解该疾病在治疗干预下的免疫学变化提供数据支持。该研究属于免疫系统疾病范畴，主题标签为转录组或基因表达，体现了以高通量测序手段研究基因表达特征的研究方向。

【数据内容】

该数据集的核心内容是TAFRO综合征患者加用西罗莫司治疗前后的外周血单细胞RNA测序数据。数据覆盖治疗前与治疗后两个时间点的外周血样本，可用于比较治疗前后外周血细胞的转录组与基因表达特征。从数据类型的角度看，其主题标签为转录组或基因表达，说明数据主要反映基因表达层面的信息。单细胞RNA测序能够提供单个细胞水平的表达谱，因此该数据集可用于分析外周血中不同细胞群体的表达模式及其在治疗前后的变化。关于具体的细胞数量、测序深度、基因数目、样本重复数等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为ncbi.nlm.nih.gov，以BioProject形式记录，编号为PRJNA1459315。BioProject是围绕某一研究计划或项目组织生物数据的集合，通常来自单一机构或联合体，并为用户提供查找该项目所产生的多种数据类型链接的入口。该数据集的英文名称为“Single-cell RNA-sequencing of peripheral blood from a TAFRO syndrome patient before and after add-on sirolimus therapy”，明确指出了样本来源为TAFRO综合征患者的外周血，时间点为加用西罗莫司治疗前后。关于具体的采样地点、采样时间、机构名称、伦理审批信息以及患者个体信息等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于免疫系统疾病相关的转录组研究，尤其是针对TAFRO综合征在治疗干预下外周血免疫细胞变化的研究。具体而言，可用于比较加用西罗莫司治疗前后外周血细胞的基因表达差异，分析不同细胞亚群的转录特征，探索治疗相关的分子响应模式。此外，该数据集也可作为单细胞RNA测序分析方法的应用案例，用于细胞类型注释、差异表达分析、细胞亚群组成比较等常见分析流程。由于主题标签为转录组或基因表达，其适用范围主要集中在基因表达与转录组层面。关于该数据集在其他疾病或治疗场景中的适用性，源站未提供。

【使用方法】

该数据集以BioProject记录的形式提供，用户可通过来源站ncbi.nlm.nih.gov查找该项目编号PRJNA1459315，并经由BioProject记录获取与该研究计划相关的数据链接。BioProject记录本身提供查找不同数据类型链接的单一入口，用户可据此定位到该项目产生的数据资源。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具建议以及数据处理步骤等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为单细胞RNA测序研究，样本来自单一TAFRO综合征患者加用西罗莫司治疗前后的外周血。由于涉及治疗前后比较，其设计适合考察同一患者在接受干预后的转录组变化。然而，关于样本量、测序质量指标、数据完整性、批次效应、细胞存活率、测序深度等质量相关信息，源站未提供。此外，该数据集是否包含重复样本、对照设置以及数据过滤标准等，源站未提供。因此，在使用该数据集时，应结合源站提供的原始记录进一步确认其适用范围与局限性。

【引用与许可】

该数据集的来源站为ncbi.nlm.nih.gov，编号为PRJNA1459315。关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制以及是否允许再分发等信息，源站未提供。用户在使用该数据集时，应参考来源站的相关政策与说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE329476

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1459315

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自一名日本TAFRO综合征患者（编号MCD32）的配对外周血单个核细胞（PBMC）单细胞RNA测序，分别采集于疾病活动期（加用西罗莫司开始前即刻）和西罗莫司1 mg/日稳定剂量治疗期间。该数据集旨在探索mTOR抑制在iMCD/TAFRO综合征中的免疫学特征，并补充了一项纳入8例难治性iMCD/TAFRO患者接受加用西罗莫司治疗的病例系列研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别