高脂血症与主动脉夹层共同基因及调控机制研究
本数据集来自 NCBI，围绕高脂血症与主动脉夹层两种疾病的共同基因及调控机制展开研究。研究对夹层与正常升主动脉组织进行转录组测序，识别与主动脉夹层相关的差异表达基因，并利用公开数据集分析高脂血症相关差异表达基因
基本信息
资源简介
高脂血症与主动脉夹层共同基因及调控机制研究
本数据集来源于 NCBI，英文名称为 PRJNA1111506: Investigation of common genes and regulatory mechanisms of hyperlipidemia and aortic dissection，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，在本站分类中归属于免疫系统疾病 / 其他。该研究围绕高脂血症与主动脉夹层两种疾病之间的共同基因及调控机制展开，核心工作包括对夹层与正常升主动脉组织进行转录组测序，识别与主动脉夹层相关的差异表达基因，并借助公开数据集分析高脂血症相关的差异表达基因。在此基础上，研究通过外部数据集验证确定两种疾病的枢纽共同基因，并进一步开展功效评估、蛋白-蛋白相互作用网络分析、免疫浸润关联分析、转录因子预测以及小分子药物分析。基于转录组测序数据和公开数据集，研究共识别出两种疾病之间的 99 个共同差异表达基因。
【数据集背景】
高脂血症与主动脉夹层是两类在临床与分子层面均受到关注的疾病。该研究旨在阐明这两种疾病所共有的基因基础及其调控机制，从而为理解二者之间可能存在的分子联系提供线索。研究的设计思路并不局限于单一疾病，而是同时考察主动脉夹层相关差异表达基因与高脂血症相关差异表达基因，并尝试从中寻找共同节点。这一思路体现了从转录组层面探索跨疾病共享机制的研究取向，也为后续的枢纽基因筛选、调控网络构建和潜在药物分析提供了出发点。
【数据内容】
本数据集的核心内容是针对夹层与正常升主动脉组织开展的转录组测序数据。研究通过测序识别与主动脉夹层相关的差异表达基因，同时利用公开可用的数据集分析与高脂血症相关的差异表达基因。在此基础上，研究确定了两种疾病之间的共同差异表达基因，数量为 99 个。围绕这些共同基因，研究还涉及外部数据集验证、功效评估、蛋白-蛋白相互作用网络分析、免疫浸润关联分析、转录因子预测以及小分子药物分析等内容。主题标签表明该数据集属于转录组或基因表达范畴。
【采集与来源】
数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。研究采集了夹层与正常升主动脉组织样本，并对其进行转录组测序。除自身产生的测序数据外，研究还使用了公开可用的数据集来分析高脂血症相关的差异表达基因，并通过外部数据集对共同基因进行验证。关于样本的具体数量、采集时间、地点、纳入排除标准以及公开数据集的具体名称与版本，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于围绕高脂血症与主动脉夹层共同分子机制的研究场景，例如差异表达基因分析、跨疾病共同基因筛选、枢纽基因识别、蛋白-蛋白相互作用网络构建、免疫浸润关联分析、转录因子预测以及小分子药物分析等。对于关注主动脉夹层转录组特征、高脂血症相关基因表达变化，以及两种疾病共享调控机制的科研人员，该数据集具有参考价值。此外，其主题标签也表明可用于转录组或基因表达相关的方法学研究与验证工作。
【使用方法】
使用该数据集时，可基于夹层与正常升主动脉组织的转录组测序数据开展差异表达分析，识别与主动脉夹层相关的差异表达基因；同时可结合公开数据集分析与高脂血症相关的差异表达基因。随后可对两组差异表达基因取交集，获得共同差异表达基因，并通过外部数据集进行验证。在此基础上，可进一步开展功效评估、蛋白-蛋白相互作用网络分析、免疫浸润关联分析、转录因子预测以及小分子药物分析。关于数据的具体下载方式、文件格式、分析流程参数与软件版本，源站未提供。
【质量与限制】
该研究基于转录组测序数据与公开数据集，识别出 99 个共同差异表达基因，并通过外部数据集验证、功效评估及多种下游分析对结果进行了考察。然而，关于样本规模、测序深度、批次效应、数据完整性、验证队列的具体构成以及研究本身的局限性，源站未提供。因此，在使用该数据集时，应结合自身研究目的谨慎评估其适用性，并注意公开数据集与自有测序数据之间可能存在的平台差异与处理差异。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为 PRJNA1111506: Investigation of common genes and regulatory mechanisms of hyperlipidemia and aortic dissection。关于具体的引用格式、许可条款、使用限制以及数据访问权限，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1111506
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在阐明高脂血症与主动脉夹层共同的基因及调控机制。总体设计：对夹层和正常升主动脉组织进行转录组测序，并鉴定与主动脉夹层相关的差异表达基因（DEGs）。此外，利用公开数据集分析高脂血症相关的DEGs。通过外部数据集验证确定两种疾病的枢纽共同基因，随后进行疗效评估、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析、免疫浸润关联分析、转录因子（TF）预测及小分子药物分析。基于转录组测序数据和公开数据集，共鉴定出两种疾病间的99个共同DEGs。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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