基本信息

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基因组

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

乳胶和/或植物性食物过敏患者基因表达谱

PRJNA110643 是一个聚焦于过敏性疾病分子机制的基因表达谱数据集，来源于 NCBI。该数据集围绕乳胶过敏、蔬菜/水果过敏以及乳胶-水果综合征三类过敏状态展开，采用 DNA 微阵列分析技术，对患者及健康对照者外周血单核细胞的基因表达情况进行筛查，旨在寻找与过敏发病机制相关的候选基因，并评估乳胶过敏与植物来源食物过敏是否涉及相似的分子通路。数据集归类于免疫系统疾病 / 其他，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，可为过敏性疾病转录组研究提供表达谱层面的基础数据。

【数据集背景】

乳胶过敏个体常表现出与植物来源食物之间的交叉超敏反应，这一现象被广泛报道为“乳胶-水果综合征”。然而，针对乳胶过敏和/或水果过敏的分子机制，现有认识仍较为有限。源站描述指出，该研究的目的在于识别可能与乳胶过敏和/或蔬菜食物过敏发病机制相关的候选基因，并评估两类超敏反应是否涉及相似的分子通路。这一背景决定了数据集的核心科学问题：从外周血单核细胞的转录组层面刻画不同过敏表型之间的共性与差异。

【数据内容】

数据集收录的是基因表达谱数据，主题标签为 Transcriptome or Gene expression。研究通过 DNA 微阵列分析，对乳胶过敏患者、水果过敏患者、乳胶-水果综合征患者以及健康对照者的外周血单核细胞进行分子谱筛查。源站描述提到，基因表达谱分析识别出一组在所有特应性患者中共同调控的重叠基因集，但该描述在原文中未完整呈现，具体基因列表、样本数量及分组规模等信息源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov，数据集英文名为 PRJNA110643: Gene expression profiling of patients with allergy to latex and/or vegetable food。生物样本为外周血单核细胞，取自乳胶过敏、水果过敏、乳胶-水果综合征患者及健康对照者。检测平台为 DNA 微阵列。除上述信息外，采样地点、时间跨度、伦理审批及样本纳入排除标准等细节源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于过敏性疾病转录组层面的探索性研究，例如比较不同过敏表型之间基因表达模式的异同、筛选与乳胶过敏或植物来源食物过敏相关的候选基因、评估乳胶-水果综合征是否与单一过敏类型共享分子通路，以及作为过敏免疫机制研究的表达谱参考数据。其外周血单核细胞来源也适合关注外周免疫细胞转录状态的研究场景。

【使用方法】

使用时应以基因表达谱数据为基础，围绕乳胶过敏、水果过敏、乳胶-水果综合征与健康对照之间的分组进行比较分析。由于源站描述未完整给出差异基因列表与统计结果，使用前需自行完成数据下载、质控与归一化，并按原始研究的分组设计开展差异表达与通路层面的分析。具体分析流程与参数设置源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于 DNA 微阵列技术，样本类型为外周血单核细胞，研究结论受限于源站描述所呈现的范围。源站描述中关于重叠基因集的表述不完整，完整的差异基因、样本量、统计显著性及验证实验结果源站未提供。因此，数据的使用应视为探索性表达谱资源，不宜直接外推为临床诊断或机制定论。

【引用与许可】

数据来自 NCBI，数据集标识为 PRJNA110643。具体的引用文献、作者信息、许可条款及使用限制源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE13619

访问原始数据

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA110643

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：对乳胶过敏且与植物源性食物存在交叉超敏反应的个体患病率常被报道，即所谓的乳胶-水果综合征。尽管如此，对乳胶和/或水果过敏的分子机制仍知之甚少。目的：本研究旨在识别可能与乳胶和/或植物性食物过敏发病机制相关的候选基因，并评估这两种超敏反应是否涉及相似的分子通路。方法：采用DNA微阵列分析，对从乳胶过敏、水果过敏或乳胶-水果综合征患者以及健康对照受试者中分离的外周血单核细胞的分子谱进行筛选。结果：基因表达谱分析鉴定出一个重叠的基因数据集，这些基因在本研究纳入的所有特应性患者中均受到共同调控，提示水果和/或乳胶过敏的发病机制涉及相似的分子机制。

几种固有免疫和获得性免疫的调节因子据报道可使免疫反应向Th2介导的免疫反应极化，这些因子在患者中过表达。此外，有证据表明，过敏性患者的T调节细胞表达可能存在缺陷，这是某些炎性细胞因子失调的结果。最后，一些可能导致Th1/Th2失衡的转录因子在过敏性患者中受到调控。结论与临床意义：本研究鉴定了一些相关基因，可能有助于阐明过敏性疾病潜在的分子机制。对关键靶点以及调控基因活性的转录因子的认识可能促进新疗法的开发。总体设计：本研究旨在了解乳胶和水果过敏所涉及的分子通路。由于乳胶和植物性食物过敏原存在交叉反应，可以假设

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别