基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

肝硬化患者循环单核细胞上调CD52并维持固有免疫功能直至急性失代偿出现

该数据集为 NCBI BioProject 收录的一项生物项目，编号为 1095842，英文标题为“Distinct circulating monocytes up-regulate CD52 and sustain innate immune function in patients with cirrhosis unless acute decompensation emerges”。从标题可以看出，该研究关注肝硬化患者外周循环单核细胞的异质性，以及这些细胞在急性失代偿发生前后对 CD52 表达和固有免疫功能的调控作用。数据集在主题上被标注为“转录组或基因表达”，说明其核心数据类型为基因表达层面的转录组信息。本站将其归入免疫系统疾病 / 其他分类，反映其与免疫相关疾病研究的关联。整体而言，该数据集为研究肝硬化进程中单核细胞免疫功能变化提供了可检索、可关联的组学项目入口。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号 1095842。BioProject 是围绕某一项研究计划或计划集合而建立的生物数据集合，通常由单一机构或联合体发起，旨在为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种类型数据。该项目的标题明确指向肝硬化患者循环单核细胞中 CD52 的上调现象，以及该现象与固有免疫功能维持之间的关系，并特别关注急性失代偿出现后这一关系的变化。本站分类将其置于免疫系统疾病 / 其他类别，主题标签为“转录组或基因表达”，表明该项目主要围绕基因表达谱展开研究。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，即转录组或基因表达。围绕这一主题，项目关注的是循环单核细胞的基因表达特征，尤其是 CD52 相关表达变化以及固有免疫功能相关基因的表达模式。数据集本身作为 BioProject 记录，提供的是项目层面的索引与链接，而非直接的分析结果表格。关于样本数量、测序平台、具体基因列表、表达量矩阵或统计结果等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 的 BioProject 数据库。项目编号为 PRJNA1095842，源站标题显示为“Distinct circulating monocytes up-regulate CD52 an... (ID 1095842) - BioProject - NCBI”。项目发起机构、样本采集地点、采集时间、受试者纳入与排除标准、伦理审批信息等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于免疫系统疾病相关研究，尤其是肝硬化背景下循环单核细胞转录组与固有免疫功能的研究。可用于探索 CD52 在单核细胞中的表达调控，以及急性失代偿对固有免疫功能的影响。也可作为转录组或基因表达数据挖掘的入口，用于比较不同疾病状态下单核细胞的基因表达特征。具体分析场景需结合项目实际产生的数据文件，源站未提供详细说明。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库，以项目编号 PRJNA1095842 检索并访问该记录。BioProject 记录提供指向该项目所产生各类数据的链接，便于用户定位相关转录组或基因表达数据。具体的数据下载方式、分析流程、软件工具及参数设置，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 BioProject 项目记录，其质量取决于项目提交方提供的信息完整性与准确性。由于源站未提供样本量、测序深度、重复数、质控指标等细节，无法对数据质量进行具体评估。此外，该记录本身不包含原始数据或分析结果，仅作为项目索引存在。使用时应结合项目关联的实际数据文件进行判断。

【引用与许可】

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE263100

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1095842

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景与目的：感染性并发症决定肝硬化患者的预后。其感染易感性与免疫麻痹的发生有关，免疫麻痹是不同免疫抑制细胞和可溶性因子之间复杂的相互作用。固有免疫免疫麻痹动态变化的机制仍不明确。我们旨在剖析不同肝硬化阶段循环单核细胞状态的异质性，并探究所选差异表达（DE）基因的功能。方法：我们采用单细胞RNA测序系统研究了健康、代偿期和非急性失代偿（NAD）期肝硬化中的循环单核细胞。通过流式细胞术和离体单核细胞的多种功能实验对选择性基因进行了验证。结果：我们鉴定出七个单核细胞簇。其丰度在不同肝硬化阶段之间存在差异，证实了先前报道的变化，即晚期阶段CD14lowCD16++减少以及M-MDSC出现。检测到健康与疾病之间以及不同阶段之间的差异表达基因，其中首次包括CD52。在代偿期和NAD期肝硬化中，单核细胞上CD52的表达显著增强。

迄今为止，单核细胞上CD52表达的生物学意义在于增强迁移潜能、增加细胞因子产生，但T细胞活化能力较差。急性失代偿（AD）后，CD52被升高的磷脂酶C（PLC）切割，循环中可检测到可溶性CD52（sCD52）。抑制和切割CD52在离体和体外均显著抑制单核细胞功能，而AD患者中占优势的免疫抑制性CD52低表达循环单核细胞与感染及低无移植生存率相关。结论：CD52可能成为未来免疫治疗中具有生物学相关性的靶点。稳定CD52可能增强肝硬化背景下单核细胞功能和感染控制，并以sCD52/PLC作为指示免疫麻痹的生物标志物进行指导。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别