乳糜泻患者与健康对照的初始B细胞受体重链库

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 513999),收录乳糜泻患者与健康对照的初始 B 细胞受体重链库数据,主题标签为 Transcriptome or Gene expression,属于免疫系统疾病相关数据

sra
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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJEB26509: Naive B-cell receptor heavy chain repertoire of celiac patients and healthy controls

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

乳糜泻患者与健康对照的初始B细胞受体重链库

PRJEB26509 是一个来自 NCBI BioProject 的公开数据集,其英文全称为 Naive B-cell receptor heavy chain repertoire of celiac patients and healthy controls。该数据集聚焦于乳糜泻患者与健康对照人群的初始 B 细胞受体重链库,主题标签为 Transcriptome or Gene expression,在分类上属于免疫系统疾病相关数据。BioProject 作为生物数据集合,通常围绕某一项研究计划而建立,由单一机构或联合体发起,并为用户提供统一入口,以便查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集即通过 BioProject 记录形式对外呈现,编号为 ID 513999,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。整体而言,它为研究乳糜泻相关免疫特征提供了以 B 细胞受体重链库为切入点的转录组或基因表达层面的数据资源。

【数据集背景】

该数据集所对应的研究关注乳糜泻患者与健康对照之间的免疫学差异,具体落在初始 B 细胞受体重链库这一对象上。乳糜泻属于免疫系统疾病范畴,而 B 细胞受体在适应性免疫应答中承担抗原识别功能,其重链库的组成与多样性是免疫状态的重要观察维度。数据集以患者与健康对照的对比设计,为理解疾病相关免疫特征提供了基础材料。其主题标签为 Transcriptome or Gene expression,说明数据与转录组或基因表达相关。源站标题显示为“ID 513999 - BioProject - NCBI”,表明该资源以 BioProject 记录形式组织。关于该研究计划的具体发起机构、资助来源及研究假设等背景信息,源站未提供。

【数据内容】

从数据集名称可知,其内容为初始 B 细胞受体重链库数据,覆盖乳糜泻患者与健康对照两类人群。主题标签为 Transcriptome or Gene expression,提示数据属于转录组或基因表达范畴。BioProject 记录本身是相关生物数据的集合,旨在为用户提供查找该项目所生成多种数据类型的统一入口。因此,该数据集可能包含与 B 细胞受体重链库相关的序列或表达信息,但具体的数据文件类型、样本数量、序列条数、基因或克隆计数等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject,编号为 ID 513999,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 记录通常由单一组织或联合体发起,用于汇集与某一研究计划相关的生物数据。该数据集即通过这一平台对外发布,其英文名称明确指向乳糜泻患者与健康对照的初始 B 细胞受体重链库。关于样本采集地点、采集时间、受试者招募标准、伦理审批信息以及具体实验流程等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于免疫系统疾病相关研究,尤其是乳糜泻方向的探索。由于主题标签为 Transcriptome or Gene expression,它可用于转录组或基因表达层面的分析场景。具体而言,研究者可能将其用于比较乳糜泻患者与健康对照在初始 B 细胞受体重链库上的差异,或作为免疫受体库研究的参考数据。此外,BioProject 作为多数据类型入口,也可帮助用户定位同一项目下的其他相关数据。关于该数据集是否适用于临床诊断、药物开发或特定统计建模等具体用途,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 平台访问,记录编号为 ID 513999,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。用户可借助 BioProject 记录查找该项目所生成的多种数据类型链接。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析工具、参数设置及处理流程等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject,属于公开生物数据资源。其主题标签为 Transcriptome or Gene expression,分类为免疫系统疾病 / 其他。关于数据质量评估指标、测序深度、覆盖度、批次效应、样本量大小及潜在偏倚等具体信息,源站未提供。因此,使用者在解释结果时需注意这些未明示的限制。

【引用与许可】

该数据集来源于 NCBI BioProject,编号为 ID 513999,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的正式引用格式、许可条款、使用限制及授权要求等,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB26509

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自挪威100名个体血液样本的初始B细胞抗体库高通量测序数据集。其中48名健康对照和52名乳糜泻患者。测序使用Illumina MiSeq的300*2双端试剂盒进行。

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