人类T细胞多维分析揭示高CD38表达标记近期胸腺迁出细胞与年龄相关初始T细胞重塑
“人类T细胞多维分析揭示高CD38表达标记近期胸腺迁出细胞与年龄相关初始T细胞重塑”（Synapse ID: syn53238645）是Synapse上的一个项目
基本信息
资源简介
人类T细胞多维分析揭示高CD38表达标记近期胸腺迁出细胞与年龄相关初始T细胞重塑
该数据集英文名为“Multidimensional profiling of human T cells reveals high CD38 expression marking recent thymic emigrants and age-related naive T cell remodeling”，中文可译为“人类T细胞多维分析揭示高CD38表达标记近期胸腺迁出细胞与年龄相关初始T细胞重塑”。它发布在Synapse平台上，项目编号为syn53238645，在本站归入“免疫系统疾病 / 其他”分类。从名称与源站描述看，该项目的核心主题是围绕人类T细胞开展多维度的分析工作，重点关注CD38高表达与近期胸腺迁出细胞之间的标记关系，以及伴随年龄增长而发生的初始T细胞重塑现象。以下依据可获得的信息，对该数据集作分段介绍。
【数据集背景】
该数据集所属项目聚焦人类T细胞的多维分析。T细胞是免疫系统的重要组成部分，其发育、迁出与随年龄变化的组成重塑，是免疫学研究的常见议题。项目名称直接点明了两个相互关联的关注点：一是以高CD38表达作为近期胸腺迁出细胞的标记特征，二是年龄相关的初始T细胞重塑。源站将其描述为Synapse上的一个项目，说明其定位是面向研究社区共享与协作的科学项目资源，而非单纯的表格文件集合。关于该项目立项的具体背景、研究动机的详细阐述以及所针对的科学问题分解，源站未提供。
【数据内容】
依据数据集名称与源站描述，该项目涉及人类T细胞的多维分析数据，分析维度涵盖CD38表达水平与近期胸腺迁出细胞标记之间的关系，以及不同年龄条件下初始T细胞的重塑特征。项目名称中的“多维分析”提示数据可能包含多个测量维度上的T细胞特征信息，但具体的维度构成、检测指标种类、样本数量、分组设计以及数据文件的具体形态，源站未提供。本站分类将其归入“免疫系统疾病 / 其他”，这一归类反映了该资源在站内分类体系中的位置，但项目本身与具体疾病之间的关联细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为synapse.org，源站以项目形式对其进行描述，项目标识为syn53238645。Synapse是面向生物医学研究数据共享与协作的平台，项目页面通常承载数据文件、说明文档与协作信息。关于样本采集的具体人群、采集地点、采集时间、伦理审批信息、实验平台与检测方法等技术细节，源站未提供。数据从原始采集到形成可共享项目的完整流程，源站未提供。
【适用场景】
基于项目主题，该数据集适用于与人类T细胞免疫特征相关的研究场景，例如探讨CD38表达作为近期胸腺迁出细胞标记的可行性、分析年龄因素与初始T细胞组成变化之间的关系，以及作为T细胞多维分析方法的参考数据资源。由于本站分类为“免疫系统疾病 / 其他”，它也可能在免疫相关疾病背景下的T细胞特征比较研究中作为参照。上述适用方向系依据项目名称与分类所作的领域层面说明，项目自身是否明确声明了适用场景与使用建议，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以Synapse项目（syn53238645）的形式发布，使用者通常需通过Synapse平台访问项目页面，了解项目说明并获取其中共享的数据内容。关于数据文件的具体组织方式、下载途径、访问权限设置、配套的分析代码或处理流程，源站未提供。因此，实际使用时应以Synapse项目页面所载信息为准，源站未提供更细化的使用指引。
【质量与限制】
该数据集来自Synapse平台上的公开项目条目，其项目名称与描述信息完整可辨。但就数据质量而言，如样本量、重复性、批次效应、缺失值情况、质控标准等关键指标，源站未提供，无法据此评估数据的技术质量。使用限制方面，数据的访问条件、使用范围约束以及是否存在敏感信息保护要求，源站未提供。使用者应在获取数据前自行核实项目页面的最新说明。
【引用与许可】
该数据集的英文名称与Synapse项目编号syn53238645可作为识别与引用该资源的基本信息。关于该数据集的正式引用格式、作者列表、发表文献、许可协议类型以及再分发条件，源站未提供。使用者在引用或再利用前，应查阅Synapse项目页面以确认相关要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://synapse.org/Synapse:syn53238645
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
“人类T细胞的多维图谱分析揭示高CD38表达标记近期胸腺迁出细胞及年龄相关的初始T细胞重塑”论文的数据。胸腺退化是人类免疫衰老的关键因素，导致胸腺输出减少及循环中近期胸腺迁出细胞（RTE）初始T细胞下降。目前，人类RTE的精确界定及其对应的细胞表面标志物尚不明确。单细胞RNA测序/ATAC测序数据分析通过_SOX4_、_IKZF2_和_TOX_的表达及CD38蛋白区分了RTEs，其中表面CD38^hi^表达普遍标识了CD8^+^和CD4^+^ RTEs。我们进一步在158人的队列中确定了RTEs和成熟细胞的动态变化，包括与年龄相关的转录重编程和细胞因子产生的变化。光谱流式细胞术分析揭示了初始CD8^+^和CD4^+^ T细胞共有的两条衰老轴：(1) CD38^++^细胞（RTEs）减少；(2) CXCR3^hi^细胞增加。RTEs的识别使得直接评估胸腺健康状况成为可能。
此外，解析初始T细胞重塑的动态变化有助于深入理解整个衰老过程中的疫苗接种和感染应答。数据浏览链接： 单细胞数据集 1. 单细胞初始CD8细胞（Terekhova、Swain、Bohacova等）：https://artyomovlab.wustl.edu/sce/?token=CD8_Naive_Terekhova 2. 单细胞初始CD4细胞，子集100,000个细胞（Terekhova、Swain、Bohacova等）：https://artyomovlab.wustl.edu/sce/?token=CD4_Naive_Terekhova 3. 单细胞初始CD8细胞（Mogilenko等）：https://artyomovlab.wustl.edu/sce/?token=CD8_Naive_Mogilenko 4. 单细胞初始CD4细胞（Mogilenko等）：https://artyomovlab.wustl.edu/sce/?token=CD4_Naive_Mogilenko 5. 单细胞多组学初始CD8细胞：https://artyomovlab.wustl.edu/sce/?token=CD8_Naive_Multiome 6. 单细胞多组学初始CD4细胞：https://artyomovlab.wustl.edu/sce/?token=CD4_Naive_Multiome **批量
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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