Kumasi队列研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT01853657

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：HIV。研究设计：开放性随机研究。招募：所有接受稳定抗逆转录病毒治疗（ART）至少一年的患者，在充分了解研究目的/程序及相关不便/风险后，将被邀请参与研究。在获得知情同意后，患者将被要求完成一份关于其抗逆转录病毒治疗史的简短问卷，包括药物依从性、药物供应可靠性、高效抗逆转录病毒治疗（HAART）的副作用和并发症等信息。将记录社会经济状况、与抗逆转录病毒治疗相关的感知困难以及HIV治疗项目所提供护理和支持的主观质量等数据。随机化：患者将被随机分配至I组（n=1500），除按照下述算法进行临床和免疫学监测外，还进行病毒载量检测（VL）；或分配至II组（所有其他符合条件的患者，至少n=1500），仅进行临床和免疫学监测（CI）。随机化将根据计算机生成的列表进行。

血液采样：除用于HIV服务常规检查（CD4细胞计数、生化检查）所采集的血液外，还将从所有纳入研究的患者中额外采集10ml血样（5ml EDTA抗凝血、5ml血清），用于病毒载量及抗逆转录病毒治疗（ART）结局的主要混杂因素（如病毒性肝炎）分析。此外，对于II组（CI）中因临床或免疫学失败而准备换用二线ART的患者，在换药前将采集一份血样（5ml EDTA血浆）用于病毒载量分析。病毒载量分析：为确保病毒载量检测能够及时用于临床，需要采用即时检测（point of care testing），并应在KATH建立。KATH已安装一台Cobas® Amplicore分析仪（Roche Diagnostics），虽然功能正常，但由于资源缺乏，并未常规使用。病毒载量检测应在工作人员接受充分培训及仪器维护后开展。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。