过氧化物还原酶Asp f3作为烟曲霉氧化还原传感器

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE173349

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

人类致病真菌烟曲霉（Aspergillus fumigatus）可被免疫功能正常宿主的先天免疫轻易清除，但在免疫功能低下的个体中却可引发严重感染，如侵袭性曲霉病（IA）。感染过程中，真菌的氧化还原稳态会受到活性氧（ROS）的挑战，这些ROS或来源于先天免疫细胞的氧化爆发，或来源于抗真菌药物的作用。过氧化物还原酶Asp f3被发现对于在小鼠中引发IA至关重要，但Asp f3如何整合进真菌氧化还原稳态仍不清楚。在此，我们展示在体内Asp f3充当ROS的传感器。虽然在最小生长条件下真菌菌丝的全局转录完全独立于Asp f3，但氧化应激反应的强劲诱导需要该过氧化物还原酶的存在。缺乏Asp f3的菌丝无法激活若干氧化还原活性基因，如胶霉毒素生物合成基因簇的成员以及Afyap1调节子的核心成员——Afyap1是真菌ROS防御机制的中心激活因子。

在敲除asp f3基因后，Afyap1在ROS暴露期间的核定位显著减少，表明Asp f3可作为多种靶蛋白的细胞内氧化还原传感器。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。