慢性乙型肝炎患者基因发现以识别导致B细胞和NK细胞失调的未知通路

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT06853886

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：慢性乙型肝炎病毒感染。得益于ANRS过去的资助，我们在体外人类模型中证实，乙型肝炎病毒（HBV）感染中B细胞和NK细胞均存在功能障碍，并在慢性感染患者中得到验证。我们观察到，B细胞通过Toll样受体9（TLR9）介导的应答被HBV病毒蛋白HBsAg所抑制。我们注意到，HBV导致所有B细胞亚群上TLR9表达的缺失，其机制是通过阻断转录因子CREB的磷酸化（pCREB）而使其启动子活性丧失。此外，在慢性乙型肝炎（CHB）患者中，B细胞TLR9介导的应答（如增殖和细胞因子产生）被消除。对于NK细胞，我们证实其受体表达出现若干显著变化，与健康供者相比，细胞因子IFN-γ、MIP1a的產生及细胞毒性均丧失。然而，对于NK细胞和B细胞功能障碍，该现象的分子基础和信号通路尚不清楚，且这一状态能否被逆转——一个具有治疗重要性的问题——仍属未知。我们假设，CHB患者NK细胞中发生若干分子改变，这些改变依赖于HBV（更具体地说是HBsAg）对mTOR通路的改变。

综合来看，本提案的结果应能界定导致B细胞和NK细胞功能的遗传特征，并将有助于我们理解HBV引起的免疫功能障碍。在NK细胞和B细胞研究中，我们将探索疾病不同慢性阶段所发生的遗传改变。这只能在包括CHB所有临床阶段的患者中进行研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。