功能不同的CD8+皮肤驻留记忆T细胞的分子网络差异
该数据集来自 search.dataone.org,主题为皮肤驻留记忆 T 细胞的分子调控网络。源站描述显示,皮肤驻留 CD8+ T 细胞包含产生 IFN-γ 的 TRM1 与产生 IL-17 的 TRM17 两个亚群,二者建立组织驻留的机制不同:TRM1 依赖 T-bet-Hobit-IL-15

基本信息
资源简介
功能不同的CD8+皮肤驻留记忆T细胞的分子网络差异
Divergent molecular networks program functionally distinct CD8+ skin-resident memory T cells
该数据集来自 search.dataone.org,主题为皮肤驻留记忆 T 细胞的分子调控网络。源站描述显示,皮肤驻留 CD8+ T 细胞包含产生 IFN-γ 的 TRM1 与产生 IL-17 的 TRM17 两个亚群,二者建立组织驻留的机制不同:TRM1 依赖 T-bet-Hobit-IL-15 轴,TRM17 则独立于这些因子,由 c-Maf 驱动与 Hobit 平行的驻留程序,并以 ICOS-c-Maf-IL-7 轴为关键。靶向该通路可清除皮肤 TRM17 而不影响 TRM1。数据可用于研究皮肤局部免疫调控与 T 细胞记忆机制(来源 DataONE)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):皮肤驻留 CD8+ T 细胞包含产生 IFN-γ(TRM1)和产生 IL-17(TRM17)的不同亚群,它们对免疫应答的贡献不同。然而,这些群体是否采用共同机制建立组织驻留尚不清楚。在此,我们表明 TRM1 和 TRM17 细胞通过不同的轨迹在皮肤中获得组织驻留。TRM1 细胞依赖 T-bet-Hobit-IL-15 轴,而 TRM17 细胞独立于这些因子发育。相反,c-Maf 在 TRM17 细胞中指挥一个组织驻留程序,与 Hobit 在 TRM1 细胞中诱导的程序平行,其中 ICOS-c-Maf-IL-7 轴对 TRM17 细胞定向至关重要。因此,靶向该通路能够清除皮肤 TRM17 细胞而不损害其 TRM1 对应细胞。因此,皮肤驻留 T 细胞依赖不同的分子回路,可利用这些回路来策略性地调节局部免疫。Mice C
【主题与分类】
主题标签:Tissue-resident memory T cells、Skin、Skin immunity、T cells、immune memory、T cell memory。本站分类:免疫系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A444bc49198a6c056715b0cb9052e96f8e2193104f0e1880688b49ca7ff8206df
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- OpenDataLab:
数据说明
皮肤驻留CD8+ T细胞包括不同的IFN-γ产生型(TRM1)和IL-17产生型(TRM17)亚群,它们对免疫应答的贡献各异。然而,这些细胞群体是否采用共同机制来建立组织驻留尚不清楚。在此,我们展示TRM1和TRM17细胞通过不同的途径获得皮肤组织驻留能力。TRM1细胞依赖于T-bet-Hobit-IL-15轴,而TRM17细胞的发育则不依赖这些因子。相反,c-Maf在TRM17细胞中指挥一个组织驻留程序,这一程序与Hobit在TRM1细胞中诱导的程序平行,其中ICOS-c-Maf-IL-7轴对TRM17细胞的分化至关重要。因此,针对这一通路的干预能够在不影响TRM1细胞的情况下消除皮肤TRM17细胞。
因此,皮肤驻留T细胞依赖于独特的分子回路,这些回路可被利用来策略性地调节局部免疫。小鼠C57BL/6、B6.SJL‐PtprcaPep3b/BoyJ (CD45.1)、B6.SJL‐PtprcaPep3b/BoyJ×C57BL/6 (CD45.1×CD45.2)、OT-I×B6.SJL-PtprcaPep3b/BoyJ (OT-I.CD45.1)、T-bet-ZsGreen×Rorgt-E2Crimson、Tgfbr2flox/flox×dLck-cre (Tgfbr2−/−)、Tbx21−/−、Tbx21−/−×Eomes×Cd4cre、Nfil3−/−、HobitTomato、Blimp1Tomato、Il15−/−、lox-stop-lox-Tgfbr1CA (Tgfbr1CA)×Cd8(E8i)cre、Tracflox/flox×Rosa26creERT2/+、Zfp683−/− (Hobit-KO)、Mafflox/flox×Cd4cre (c-Maf-cKO)和Icos−/−小鼠均在澳大利亚墨尔本大学微生物学与免疫学系繁育和维持。HobitTomato和Blimp1Tomato由Kallies实验室通过将串联tomato表达盒分别插入内源性Zfp683和Blimp1基因座而生成。对于联体共生实验,C57BL/6和B6.SJL‐PtprcaPep3b/BoyJ (CD45.1)小鼠分别获自NIAID Taconic交换项目或购自The Jackson Laboratory,并饲养于美国贝塞斯达国立卫生研究院。
BowieÃRag1â/â 转…, , # 不同的分子网络编程功能
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




