基于非负矩阵分解的六种食物过敏基本原型数据集
主题标签：食物过敏、过敏原交叉反应、非负矩阵分解、SQLite数据库、免疫系统疾病。本数据集为免疫系统疾病领域公开数据集，由Zenodo提供，主题涵盖食物过敏。
基本信息
资源简介
基于非负矩阵分解的六种食物过敏基本原型数据集
该数据集全称为 Dataset for "Six fundamental archetypes of food allergy revealed via non-negative matrix factorization"，是一项面向免疫系统疾病领域的公开数据资源，在本站归入免疫系统疾病 / 其他类别，由 Zenodo 提供并发布于 doi.org。数据集的核心内容是论文《Six fundamental archetypes of food allergy revealed via non-negative matrix factorization》中用于过敏原交叉反应分析的主 SQLite 数据库文件（allergen_database.sqlite）。该数据集作者为 Heo, Jaeuk，发布时间为 2026 年，采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可协议开放共享。其主题涵盖食物过敏、过敏原交叉反应、非负矩阵分解以及 SQLite 数据库等方向，适合关注食物过敏机制研究与过敏原交叉反应分析的研究人员使用。
【数据集背景】
食物过敏是免疫系统疾病中的重要研究方向，过敏原之间的交叉反应现象对临床诊断与过敏原管理具有直接影响。该数据集服务于一项以非负矩阵分解方法解析食物过敏基本类型的论文研究，其构建目的是为论文中的过敏原交叉反应分析提供底层数据支撑。通过将过敏原相关信息组织为结构化数据库，研究者可以在统一的数据基础上开展交叉反应模式的挖掘与验证，进而支撑食物过敏分型相关结论的复现与延伸分析。
【数据内容】
数据集的主体是一个 SQLite 格式的数据库文件，文件名为 allergen_database.sqlite。该文件是论文中过敏原交叉反应分析所使用的主数据库。SQLite 是一种轻量级、嵌入式的关系型数据库格式，便于以单文件形式分发和携带，使用者无需部署独立的数据库服务即可直接读取其中的结构化数据。源站描述中明确该数据库用于过敏原交叉反应分析，但未提供数据库内的具体表结构、字段定义、记录条数或过敏原条目明细。
【采集与来源】
该数据集由作者 Heo, Jaeuk 提交，托管于 Zenodo 平台，并通过 doi.org 提供访问入口。源站描述说明该数据库是论文中过敏原交叉反应分析所使用的主数据库。关于原始数据的采集方式、数据来源机构、样本纳入标准以及数据处理流程，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题与内容，该数据集适用于食物过敏与过敏原交叉反应相关的研究场景，尤其是需要复现或扩展论文中非负矩阵分解分析的工作。研究者可将其作为过敏原交叉反应分析的基础数据源，用于检验分型结果、开展方法学比较或进行二次挖掘。此外，对于关注免疫系统疾病数据资源建设的研究者，该 SQLite 数据库也可作为结构化过敏原数据的参考样例。需要说明的是，源站未提供该数据集在其他具体应用场景中的验证信息。
【使用方法】
使用者可通过 doi.org 上的记录获取该数据集，下载后以 SQLite 数据库方式打开 allergen_database.sqlite 文件，即可访问其中的结构化数据。由于该文件为论文分析所用的主数据库，使用者可结合论文中描述的非负矩阵分解流程对数据进行相应分析。关于数据库的具体表结构、查询示例、依赖软件环境及分析脚本，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可，允许在署名条件下使用与再分发。其内容范围限于论文中过敏原交叉反应分析所用的主数据库，源站未提供数据完整性评估、准确性验证、更新维护计划或已知偏差说明。使用者应注意，该数据集为特定论文研究配套资源，其覆盖范围与适用边界应以源站描述为准，源站未提供的质量指标不应被视为已具备。
【引用与许可】
使用该数据集时应遵循 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可协议，给予适当署名。引用时建议参考数据集英文名称 Dataset for "Six fundamental archetypes of food allergy revealed via non-negative matrix factorization"、作者 Heo, Jaeuk、发布平台 Zenodo 及发布年份 2026。关于具体的引用格式、DOI 编号及论文引用信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.21714755
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 27.6 MB。
数据说明
该数据集包含论文《通过非负矩阵分解揭示食物过敏的六种基本原型》中用于过敏原交叉反应性分析的主要SQLite数据库（allergen_database.sqlite）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
