数据来源:幼鸟与候鸟作为禽流感病毒季节性流行的驱动因素

该数据集来自 Dryad,对应 2013 年一项关于低致病性禽流感病毒(LPAIV)在野鸟中季节性流行驱动机制的研究。研究以小空间尺度、完整年度周期采样关键宿主物种绿头鸭 Anas platyrhynchos,同时测量当前感染与既往感染(病毒流行率与血清流行率)

DryadDryad
dryad
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医学影像分类CT-valueinfectious diseasesubtypeinfection intensitynucleoproteinAnas platyrhynchosviral prevalenceage
Data from: Juveniles and migrants as drivers for seasonal epizootics of avian influenza virus

基本信息

模态
医学影像
大小
0.000138336 GB
任务类型
分类
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

数据来源:幼鸟与候鸟作为禽流感病毒季节性流行的驱动因素

Data from: Juveniles and migrants as drivers for seasonal epizootics of avian influenza virus

该数据集来自 Dryad,对应 2013 年一项关于低致病性禽流感病毒(LPAIV)在野鸟中季节性流行驱动机制的研究。研究以小空间尺度、完整年度周期采样关键宿主物种绿头鸭 Anas platyrhynchos,同时测量当前感染与既往感染(病毒流行率与血清流行率)。数据可用于分析宿主密度、免疫未成熟幼鸟及候鸟易感性对 LPAIV 季节动态的影响,并支持感染强度、亚型、年龄等相关研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2013。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):1. 与其他传染病类似,低致病性禽流感病毒(LPAIV)的流行率已被观察到呈现明显的季节性变化。然而,驱动野鸟中这种变化的机制尚未得到检验。我们研究了先前提出的三种驱动野鸟 LPAIV 感染季节性动态的假说的有效性:(1)宿主密度,(2)免疫未成熟的幼鸟,(3)候鸟易感性增加。2. 为解决这些问题,我们在小空间尺度上,对整个完整年度周期进行全面采样,采集了一种关键 LPAIV 宿主物种——绿头鸭 Anas platyrhynchos,测量当前感染和既往感染(即病毒流行率和血清流行率)。3. 我们证明 LPAIV 流行率在夏季有一个次要高峰,在秋季有一个主要高峰,在此期间被采样种群的一半被感染,而在春季没有感染

【主题与分类】

主题标签:CT-value、infectious disease、subtype、infection intensity、nucleoprotein、Anas platyrhynchos、viral prevalence、age。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.j855b

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 138.3 KB。

数据说明

  1. 与其他传染病相似,低致病性禽流感病毒(LPAIV)的流行呈现出明显的季节性变化。然而,驱动野生鸟类中这种变化的机制尚未得到验证。我们研究了先前提出的三种驱动野生鸟类LPAIV感染季节性动态的因素的有效性:(1)宿主密度,(2)免疫学上未接触过病原体的幼鸟,以及(3)迁徙鸟易感性的增加。2. 为了解决这些问题,我们在小空间尺度上,对LPAIV的关键宿主物种——绿头鸭(Anas platyrhynchos)进行了采样,全面覆盖了一个完整的年度周期,同时测量了当前感染和既往感染(即病毒流行率和血清流行率)。3. 我们证明了LPAIV流行率在夏季有一个次要高峰,在秋季有一个主要高峰,在此期间半数采样种群被感染,而春季则无感染。针对AIV保守基因片段的抗体血清流行率在冬季达到高峰,并在春季再次达到高峰。4. LPAIV流行率的夏季高峰与未换羽的幼鸟进入种群的时间相吻合。

此外,幼鸟比成鸟更易感染、排毒量更高,且更不易检测到针对AIV的抗体。通过稳定氢同位素分析识别出的候鸟到达,似乎驱动了LPAIV感染的秋季高峰,表现为时间上的重合以及候鸟中更高的感染流行率。值得注意的是,在整个秋季迁徙期间,候鸟的血清流行率显著低于病毒流行率,这进一步表明每一波候鸟都放大了当地AIV的传播。最后,尽管宿主数量在整个秋季增加,但在冬季达到高峰,与LPAIV感染的两个高峰均无直接对应关系。5. 在流行病学相关的空间尺度上,我们提供了强有力的证据,表明候鸟是LPAIV季节性动物流行病的关键驱动因素,

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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