自身免疫性肝炎与原发性胆汁性胆管炎唾液自下而上蛋白质组学数据集
Giulia Guadalupi，自身免疫性肝炎与原发性胆汁性胆管炎唾液的自下而上蛋白质组学 [数据集]。主题标签：自身免疫性肝炎、原发性胆汁性胆管炎、唾液蛋白质组学、免疫系统疾病
基本信息
资源简介
自身免疫性肝炎与原发性胆汁性胆管炎唾液自下而上蛋白质组学数据集
该数据集题为 Bottom-up Proteomics of Saliva in Autoimmune Hepatitis and Primary Biliary Cholangitis，由 Giulia Guadalupi 提交，收录于 ebi.ac.uk 的 PRIDE Archive，项目编号为 PXD039847。数据集聚焦自身免疫性肝炎与原发性胆汁性胆管炎这两类免疫系统疾病，采用自下而上（bottom-up）蛋白质组学策略对唾液样本进行研究，主题标签涵盖自身免疫性肝炎、原发性胆汁性胆管炎、唾液蛋白质组学与免疫系统疾病。在本站分类中，该数据集归入免疫系统疾病 / 其他类别。它为关注自身免疫性肝病生物标志物与唾液蛋白质组的研究者提供了一个可检索、可引用的数据资源入口。
【数据集背景】
自身免疫性肝炎与原发性胆汁性胆管炎均属于免疫系统疾病范畴，是本数据集所针对的两类疾病对象。数据集以唾液为研究材料，将自下而上蛋白质组学方法应用于这两类疾病的唾液样本分析，主题标签中同时列出了自身免疫性肝炎、原发性胆汁性胆管炎、唾液蛋白质组学与免疫系统疾病，说明其研究定位围绕免疫系统疾病背景下的唾液蛋白质组展开。关于这两类疾病的具体流行病学、病理机制或临床背景，源站未提供。
【数据内容】
数据集英文名称为 Bottom-up Proteomics of Saliva in Autoimmune Hepatitis and Primary Biliary Cholangitis，表明其内容为自身免疫性肝炎与原发性胆汁性胆管炎唾液样本的自下而上蛋白质组学数据。数据集来源站为 ebi.ac.uk，对应 PRIDE Archive 项目 PXD039847。除上述名称、疾病对象、样本类型与方法策略外，源站未提供关于蛋白质鉴定数量、样本分组、定量结果或文件构成等更细的内容说明。
【采集与来源】
该数据集由 Giulia Guadalupi 提交，来源站为 ebi.ac.uk，源站描述中给出的引用形式为：Giulia Guadalupi, Bottom-up Proteomics of Saliva in Autoimmune Hepatitis and Primary Biliary Cholangitis [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD039847。数据采集的具体地点、时间、样本量、受试者信息及实验流程，源站未提供。
【适用场景】
基于数据集的疾病对象与方法策略，其适用场景包括：面向自身免疫性肝炎与原发性胆汁性胆管炎的唾液蛋白质组研究、免疫系统疾病相关的蛋白质组数据检索与复用，以及以唾液为样本的自下而上蛋白质组学分析参考。关于该数据集是否适用于特定临床诊断、标志物验证或跨队列比较，源站未提供相应说明。
【使用方法】
使用者可通过来源站 ebi.ac.uk 上 PRIDE Archive 的项目编号 PXD039847 定位该数据集，并按源站提供的访问方式获取数据。数据的具体下载格式、文件组织、检索接口与处理流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 PRIDE Archive 收录的蛋白质组学数据集，其质量评估信息、数据完整性说明、技术重复与生物学重复情况，源站未提供。使用时应以源站页面所载信息为准，并注意数据集仅针对自身免疫性肝炎与原发性胆汁性胆管炎的唾液样本，向其他疾病或样本类型的推广需谨慎。
【引用与许可】
引用该数据集时，可采用源站描述中给出的形式：Giulia Guadalupi, Bottom-up Proteomics of Saliva in Autoimmune Hepatitis and Primary Biliary Cholangitis [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD039847。关于该数据集的许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD039847
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Giulia Guadalupi, Bottom-up Proteomics of Saliva in Autoimmune Hepatitis and Primary Biliary Cholangitis [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD039847
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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