用于自身免疫性肝炎诊断的cfChIP-seq液体活检数据集
该数据集来自zenodo.org，包含一份cfChIP-seq基因计数CSV文件，基于血浆游离核小体染色质免疫沉淀测序，分析携带活跃组蛋白修饰的游离核小体所反映的濒死细胞基因转录
基本信息
资源简介
用于自身免疫性肝炎诊断的cfChIP-seq液体活检数据集
A cfChIP-seq liquid biopsy for the diagnosis of autoimmune hepatitis
该数据集来自zenodo.org，包含一份cfChIP-seq基因计数CSV文件，基于血浆游离核小体染色质免疫沉淀测序，分析携带活跃组蛋白修饰的游离核小体所反映的濒死细胞基因转录。样本覆盖46例儿童和34例成人自身免疫性肝炎患者，以及79例成人和10例儿童对照。数据可用于识别AIH患者肝细胞中激活的免疫相关转录过程，并探索cfChIP-seq作为自身免疫性肝炎非侵入性诊断手段的可行性（来源 Zenodo，cc-by-4.0 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2025-05-02。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：自身免疫性肝炎（AIH）是一种慢性炎症性肝病，以免疫介导的肝细胞损伤为特征，伴随显著的发病率和死亡率。患者需接受肝活检以确认诊断并确认后续缓解。尽管液体活检在肿瘤学中已成为有前景的非侵入性替代方案，但其在肝病中的适用性仍基本未被探索。在此，我们使用血浆染色质免疫沉淀测序（cfChIP-seq）分析携带活跃组蛋白修饰的游离核小体，该修饰反映濒死细胞中的基因转录。比较AIH患者血浆样本（46例儿童和34例成人）与对照组（分别为79例成人和10例儿童患者）的cfChIP-seq图谱，我们识别出AIH患者肝细胞中激活的免疫相关转录过程以及v
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 63.79 MB。数据集 DOI：10.5281/zenodo.15322324。
【主题与分类】
主题标签：自身免疫性肝炎、cfChIP-seq、液体活检、游离核小体、基因转录、免疫系统疾病。本站分类：免疫系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/records/15322324
使用许可：cc-by-4.0。
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-05-09，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
curl -L -o "cfChIP-seq_AIH_geneCounts.csv" "https://zenodo.org/api/records/15322324/files/cfChIP-seq_AIH_geneCounts.csv/content"
文件清单
cfChIP-seq_AIH_geneCounts.csv（60.8 MB）
数据集大小约 63.8 MB。
数据说明
自身免疫性肝炎（AIH）是一种慢性炎症性肝脏疾病，以免疫介导的肝细胞损伤为特征，具有显著的发病率和死亡率。患者接受肝活检以确认诊断并确定后续缓解情况。尽管液体活检已成为肿瘤学中有前景的非侵入性替代方法，但其在肝脏疾病中的适用性在很大程度上仍未被探索。在此，我们采用血浆染色质免疫沉淀测序（cfChIP-seq）技术分析携带活性组蛋白修饰的无细胞核小体，该修饰可反映濒死细胞中的基因转录情况。通过比较AIH患者（46例儿童和34例成人）与对照组（分别为79例成人和10例儿童患者）血浆样本的cfChIP-seq图谱，我们识别出AIH患者肝细胞中被激活的免疫相关转录过程，并利用配对的肝活检RNA-seq进行验证。我们开发了一种分类器，可将AIH的血浆cfChIP-seq图谱与其他涉及肝损伤的疾病区分开来。该分类器表现优异，ROC曲线下面积（AUC）达0.92。
我们的研究展示了血浆cfChIP-seq作为一种非侵入性AIH诊断工具的潜力，为减少肝活检需求、提高诊断精确度以及加深对AIH发病机制的理解提供了机会。
许可
cc-by-4.0
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