儿童过敏性致敏表观基因组关联研究数据
该数据集来自 tandf.figshare.com，配套 2019 年发表于 Epigenetics 的儿童过敏性致敏表观基因组关联研究
基本信息
资源简介
儿童过敏性致敏表观基因组关联研究数据
Epigenome-wide association study reveals methylation pathways associated with childhood allergic sensitization
该数据集来自 tandf.figshare.com，配套 2019 年发表于 Epigenetics 的儿童过敏性致敏表观基因组关联研究。数据覆盖两个出生队列（Project Viva–Boston 与 Generation R Study–Rotterdam）共 739 名儿童的中童年外周血 DNA 甲基化（Illumina HumanMethyl450K）及特应性、环境/吸入性和食物过敏原致敏信息，包含 5 个补充表格与图表文件。可用于复现或拓展表观基因组-wide 关联 meta 分析、通路与区域分析，探索儿童过敏致敏的甲基化机制（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Epigenome-wide association study reveals methylation pathways associated with childhood allergic sensitization》发表于 Epigenetics（2019），DOI：10.1080/15592294.2019.1590085。项目资助方：This work was supported by the National Institutes of Health [R01 NR013945]; National Institutes of Health [R01 HD 034568]; National Institutes of Health [UG3OD023286]; National Institutes of Health [P01 HL132825];National Institutes of Health [K23 ES022242]; National Institutes of Health [R01 AI102960]; National Institutes of Health [R01 HL 111108].。源站首次发布：2019-03-28。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：表观遗传机制整合了遗传变异与环境暴露。然而，尚未在主要儿童过敏表型中开展全面的表观基因组-wide 分析。我们检查了两个出生队列（Project Viva–Boston 和 Generation R Study–Rotterdam）中 739 名儿童的中童年外周血表观基因组-wide DNA 甲基化（Illumina HumanMethyl450K）与中童年特应性致敏、环境/吸入性和食物过敏原致敏的关联。我们进行了协变量调整的表观基因组-wide 关联 meta 分析，并对结果采用了通路和区域分析。七百零五个甲基化位点（505 个基因）与中童年特应性致敏显著横断面相关，环境过敏原致敏为 1411 个（905 个基因），食物过敏原致敏为 45 个（36 个基因）（FDRDICER1），嗜酸性食
【数据结构与技术规格】
文件数 5 个，合计 820.78 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.7854662.v2。
【主题与分类】
源站学科分类：Biophysics、Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Environmental Sciences not elsewhere classified。主题标签：Epigenome-wide DNA methylation、childhood allergy、childhood environmental allergy、childhood food allergy、allergic march、birth cohorts、meta analysis、regional analysis。本站分类：免疫系统疾病/环境过敏。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biophysics、Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Environmental Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Epigenome-wide_association_study_reveals_methylation_pathways_associated_with_childhood_allergic_sensitization/7854662
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Epigenome-wide association study reveals methylation pathways associated with childhood allergic sensitization. Taylor & Francis. Peng, Cheng; Van Meel, Evelien R.; Cardenas, Andres; L. Rifas-Shiman, Sheryl; Sonawane, Abhijeet R.; Glass, Kimberly R.; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2024-03-04，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Epigenome-wide association study reveals methylation pathways associated with childhood allergic sensitization
- DOI：10.6084/m9.figshare.7854662.v2
- 发布日期：2019-03-28
- 文件数：5 个
- 文件总体积：820.78 KB
- 源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Epigenome-wide_association_study_reveals_methylation_pathways_associated_with_childhood_allergic_sensitization/7854662
命令行下载
curl -L -o "Supplemental_Tables&Figures_Part1.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/14624903"
curl -L -o "Table S1.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/14624906"
curl -L -o "Table S3a.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/14624909"
curl -L -o "Table S3b.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/14624912"
curl -L -o "Table S5.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/14624915"
文件清单
Supplemental_Tables&Figures_Part1.pdf（511.56 KB）Table S1.xlsx（182.76 KB）Table S3a.xls（39.42 KB）Table S3b.xlsx（18.33 KB）Table S5.xlsx（68.69 KB）
文件总体积 820.78 KB（源站 API 实测）。
数据说明
表观遗传机制整合了遗传变异与环境暴露两方面因素。然而，尚未在主要儿童过敏表型中开展全面的全表观基因组分析。我们在两个出生队列（波士顿Project Viva与鹿特丹Generation R研究）的739名儿童中，考察了儿童中期外周血全表观基因组DNA甲基化（Illumina HumanMethyl450K）与儿童中期特应性致敏、环境/吸入性及食物过敏原致敏之间的关联。我们进行了协变量校正的全表观基因组关联荟萃分析，并对结果开展了通路与区域分析。共有705个甲基化位点（505个基因）与儿童中期特应性致敏显著横断面相关，1411个位点（905个基因）与环境过敏原致敏相关，45个位点（36个基因）与食物过敏原致敏相关（FDRDICER1）、嗜酸性食管炎与鼻窦炎（SIGLEC8）、特应性进程（AP5B1）及哮喘（EPX、IL4、IL5RA、PRG2、SIGLEC8、CLU）。此外，三种表型的大多数相关甲基化标记均位于推定的转录因子结合基序中。
通路分析识别出多个与特应性致敏和环境过敏原致敏相关的甲基化位点，这些位点位于参与哮喘、mTOR信号传导和肌醇磷酸代谢的基因内或附近。我们识别出多个与特应性致敏（8个区域）和环境过敏原致敏（26个区域）相关的差异甲基化区域。脐血分析中若干名义显著的甲基化位点在童年中期分析中达到表观基因组范围显著，并且我们在所检测的一部分位点中观察到显著的甲基化-时间交互作用。我们的发现为表观遗传调控通路作为儿童过敏性致敏标志物提供了见解。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.7854662.v2（source: https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Epigenome-wide_association_study_reveals_methylation_pathways_associated_with_childhood_allergic_sensitization/7854662）。
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