PRJNA391821:过敏患者抗体库数据集

数据由来自气源性过敏受试者和未接受过敏原特异性免疫治疗的过敏性对照受试者的外周血及鼻黏膜活检中人 B 细胞抗体基因重排的 DNA 序列组成,这些气源性过敏受试者正在接受针对其过敏的过敏原特异性免疫治疗

ena
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基因组分类过敏免疫系统疾病抗体基因重排B细胞过敏原特异性免疫治疗外周血鼻黏膜活检
PRJNA391821: Antibody repertoires in patients with allergies

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

PRJNA391821:过敏患者抗体库数据集

PRJNA391821 是一个聚焦过敏人群抗体组库的公开数据集,收录于免疫系统疾病/过敏分类下,来源为 ebi.ac.uk。该数据集的核心内容是抗体基因重排的 DNA 序列:样本取自受试者外周血及鼻黏膜活检中的人 B 细胞,受试者包括正在接受过敏原特异性免疫治疗的气源性过敏患者,以及未接受该治疗的过敏性对照人群。借助这批序列,研究者可以观察过敏状态下 B 细胞抗体基因重排的组成特征,并比较接受与未接受过敏原特异性免疫治疗两类人群之间的差异。数据集以序列数据为主体,围绕过敏与免疫治疗背景下的抗体组库展开,适合免疫学、过敏机制及免疫治疗相关研究参考使用。

【数据集背景】

过敏性疾病涉及机体免疫系统对过敏原的异常应答,B 细胞及其抗体基因重排是这一应答过程中的重要环节。过敏原特异性免疫治疗是針對气源性过敏的一种治疗方式,其对抗体组库的影响需要通过序列层面的观察加以刻画。该数据集正是围绕这一背景建立,纳入接受过敏原特异性免疫治疗的气源性过敏受试者与未接受该治疗的过敏性对照受试者,为在抗体基因重排层面研究过敏及免疫治疗相关免疫应答提供数据基础。

【数据内容】

数据由人 B 细胞抗体基因重排的 DNA 序列组成。样本来源包括外周血和鼻黏膜活检两类:外周血反映循环中的 B 细胞群体,鼻黏膜活检则对应局部黏膜部位的 B 细胞。受试者分为两组,一组为正在接受针对其过敏的过敏原特异性免疫治疗的气源性过敏受试者,另一组为未接受过敏原特异性免疫治疗的过敏性对照受试者。数据内容即围绕这两类样本、两类人群的抗体基因重排序列展开。

【采集与来源】

数据来源于 ebi.ac.uk,数据集英文名称为 PRJNA391821: Antibody repertoires in patients with allergies。样本采集对象为气源性过敏受试者及过敏性对照受试者,采集材料为外周血与鼻黏膜活检,采集后对其中人 B 细胞的抗体基因重排进行 DNA 序列测定。关于具体的采集时间、地点、受试者数量及测序平台等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于过敏相关免疫学研究的多个方向,包括对抗体基因重排组成进行分析、比较接受与未接受过敏原特异性免疫治疗人群的抗体组库差异、考察外周血与鼻黏膜局部 B 细胞抗体序列的特征,以及为过敏原特异性免疫治疗的免疫学机制研究提供序列层面的参考。也可用于免疫组库分析方法在过敏样本上的应用与验证。

【使用方法】

使用时可依据样本来源(外周血或鼻黏膜活检)与受试者分组(接受过敏原特异性免疫治疗的气源性过敏受试者、未接受该治疗的过敏性对照受试者)对抗体基因重排 DNA 序列进行组织与比较分析。具体的序列处理流程、分析工具与参数设置,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅包含抗体基因重排的 DNA 序列及相关样本背景信息,受试者数量、测序深度、序列读长、质控指标等均未在源站描述中给出,使用前需自行评估数据规模与适用性。由于涉及过敏人群的临床背景,结果解释应结合具体研究设计,源站未提供关于数据完整性、批次效应或偏差评估的说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可条款信息,使用与再分发前应向数据来源方核实相关规定。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA391821

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

数据包括接受过敏原特异性免疫治疗的空气过敏受试者和未接受过敏原特异性免疫治疗的过敏性对照受试者外周血及鼻活检中人B细胞抗体基因重排的DNA序列。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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