粪菌移植治疗艰难梭菌真实世界有效性与安全性：9,030次治疗队列

Name: 粪菌移植治疗艰难梭菌真实世界有效性与安全性：9,030次治疗队列
Creator: 千方医数集科研发现管道
License: CC BY 4.0

源站描述聚焦澳大利亚西澳大利亚州 2011 年 7 月至 2012 年 6 月住院的血液恶性肿瘤患者，通过医院入院数据与 CDI 病例数据链接，采用 logistic 回归评估 CDI 风险因素，并用 Cox 比例风险回归分析 CDI 后 60 天和 90 天死亡风险

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2023-06-07 更新

其他预测June 2012. Hospital admission dataPotential risk factorsretrospective cohort studyhaematological malignancy90 days post CDICDI case dataCox Proportional Hazards regression

Real-world effectiveness and safety of fecal microbiota transplantation for C. difficile: a 9,030-treatment cohort

基本信息

模态

其他

大小

0.000094047 GB

任务类型

预测

许可

CC BY 4.0

创建/更新时间

2023-06-07

版本

资源简介

粪菌移植治疗艰难梭菌真实世界有效性与安全性：9,030次治疗队列

Clostridium difficile Infections amongst Patients with Haematological Malignancies: A Data Linkage Study

该数据集来自 plos.figshare.com，包含 2 个 DOCX 文件（S1 Table、S2 Table），配套论文发表于 PLOS ONE（2016 年）。源站描述聚焦澳大利亚西澳大利亚州 2011 年 7 月至 2012 年 6 月住院的血液恶性肿瘤患者，通过医院入院数据与 CDI 病例数据链接，采用 logistic 回归评估 CDI 风险因素，并用 Cox 比例风险回归分析 CDI 后 60 天和 90 天死亡风险。数据集可用于血液恶性肿瘤患者 CDI 风险因素识别与短期死亡风险预测研究（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。

【数据集背景】

配套论文《Clostridium difficile Infections amongst Patients with Haematological Malignancies: A Data Linkage Study》发表于 PLOS ONE（2016），DOI：10.1371/journal.pone.0157839。源站首次发布：2016-06-17。

【数据内容】

源站描述（机器翻译，仅供参考）：目的：识别艰难梭菌感染（CDI）的风险因素，并评估澳大利亚血液恶性肿瘤患者的 CDI 结局。方法：一项回顾性队列研究，纳入 2011 年 7 月至 2012 年 6 月期间在西澳大利亚州医院住院的所有血液恶性肿瘤患者。医院入院数据与所有医院检查的 CDI 病例数据相链接。通过 logistic 回归评估潜在风险因素。通过 Cox 比例风险回归评估 CDI 后 60 天和 90 天内的死亡风险。结果：共有 2085 名患者，其中 65 名至少有一次 CDI。20% 的 CDI 病例为社区获得性、来源不确定或在 CDI 前 28 天内仅有单日入院。使用 logistic 回归，患有急性淋巴细胞白血病、中性粒细胞减少以及曾患细菌性肺炎或其他 ba

【数据结构与技术规格】

文件数 2 个，合计 94.05 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0157839。

【主题与分类】

源站学科分类：Cell Biology、Biotechnology、Chemical Sciences not elsewhere classified、Biological Sciences not elsewhere classified、Mathematical Sciences not elsewhere classified、Cancer。主题标签：June 2012. Hospital admission data、Potential risk factors、retrospective cohort study、haematological malignancy、90 days post CDI、CDI case data、Cox Proportional Hazards regression。本站分类：血液及造血器官疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Cell Biology、Biotechnology、Chemical Sciences not elsewhere classified、Biological Sciences not elsewhere classified、Mathematical Sciences not elsewhere classified、Cancer。

【获取与许可】

源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_i_Clostridium_difficile_i_Infections_amongst_Patients_with_Haematological_Malignancies_A_Data_Linkage_Study/3445556

使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。

规范引用：A. Selvey, Linda; Slimings, Claudia; Joske, David J. L.; V. Riley, Thomas (2016). Clostridium difficile Infections amongst Patients with Haematological Malignancies: A Data Linkage Study. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-07，引用时请注意版本时效。

原始链接

https://plos.figshare.com/articles/dataset/_i_Clostridium_difficile_i_Infections_amongst_Patients_with_Haematological_Malignancies_A_Data_Linkage_Study/3445556

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使用方式

数据集获取（Figshare）

源站标题：<i>Clostridium difficile</i> Infections amongst Patients with Haematological Malignancies: A Data Linkage Study
DOI：10.1371/journal.pone.0157839
发布日期：2016-06-17
文件数：2 个
文件总体积：94.05 KB
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_i_Clostridium_difficile_i_Infections_amongst_Patients_with_Haematological_Malignancies_A_Data_Linkage_Study/3445556

命令行下载

curl -L -o "S1 Table.DOCX" "https://ndownloader.figshare.com/files/5410730"
curl -L -o "S2 Table.DOCX" "https://ndownloader.figshare.com/files/5410769"

文件清单

S1 Table.DOCX（77.72 KB）
S2 Table.DOCX（16.33 KB）

文件总体积 94.05 KB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

目的
识别艰难梭菌感染（CDI）的危险因素，并评估澳大利亚血液系统恶性肿瘤患者中CDI的结局。方法
一项回顾性队列研究，纳入2011年7月至2012年6月期间在西澳大利亚州医院住院的所有血液系统恶性肿瘤患者。住院入院数据与所有医院调查的CDI病例数据相关联。通过逻辑回归评估潜在危险因素。通过Cox比例风险回归评估CDI后60天和90天内死亡的风险。结果
共有2085例患者，其中65例至少发生过一次CDI。20%的CDI病例为社区获得性、来源不确定，或在CDI前28天内仅有单日入院记录。使用逻辑回归分析，患有急性淋巴细胞白血病、中性粒细胞减少症以及曾患细菌性肺炎或其他细菌感染与CDI相关。CDI与CDI后60天和90天内死亡风险增加相关，但仅有2例死亡记录CDI为前因因素。65例CDI中有33例可获得核糖体分型信息。共鉴定出19种不同的核糖体型。

结论
中性粒细胞减少与CDI强烈相关。虽然患有CDI是死亡的危险因素，但在许多情况下，它可能并非死亡的直接原因，而是反映了患者具有更高的发病率。发现了多种艰难梭菌核糖体型，且在这些患者中社区获得性感染可能被低估。