下一代病原体测序预测不良事件
该数据集来自clinicaltrials.gov,聚焦血流感染(BSI)的预测研究。研究收集血浆样本并进行下一代测序(NGS),比较采样后72小时内发生BSI的患者、发生其他感染综合征的患者以及保持健康者的测序结果

基本信息
资源简介
下一代病原体测序预测不良事件
该数据集来自clinicaltrials.gov,聚焦血流感染(BSI)的预测研究。研究收集血浆样本并进行下一代测序(NGS),比较采样后72小时内发生BSI的患者、发生其他感染综合征的患者以及保持健康者的测序结果。同时前瞻性采集电子病历中的基线信息、恶性肿瘤、抗生素与化疗暴露、微生物学检测、血液学结果及感染相关事件等临床数据。研究先以约50名参与者进行探索性阶段评估预测感染的有效性,后续可能扩大至200名参与者以收集更多数据用于分析。数据可用于感染预测模型开发与验证(来源 clinicaltrials.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):条件:血流感染。将收集并储存采集但非临床诊疗所需(废弃样本)的血浆样本。NGS结果将在样本采集后立即(72小时内)发生BSI的患者、发生其他感染综合征的患者以及保持健康者之间进行比较。描述患者基线信息及恶性肿瘤、抗生素和化疗暴露、微生物学检测、血液学结果和感染相关事件的临床数据将从前瞻性电子病历中收集。初始探索阶段将检查约50名参与者,以确定预测感染的有效性。研究随后可能招募最多200名参与者以收集额外数据用于分析。
【主题与分类】
主题标签:Bloodstream Infection。本站分类:血液及造血器官疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://clinicaltrials.gov/study/NCT03226158
下载信息
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数据集获取
源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT03226158
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
条件:血流感染。将收集并储存采集但非临床诊疗所需的血浆样本(废弃样本)。NGS结果将在采样后立即(72小时内)发生BSI的患者、发生其他感染综合征的患者以及保持健康的患者之间进行比较。将从前瞻性电子病历中收集描述患者基线信息及恶性肿瘤、抗生素和化疗暴露、微生物学检测、血液学结果和感染相关事件的临床数据。初始探索阶段将检查约50名参与者,以确定预测感染的有效性。随后,研究可能招募最多200名参与者,以收集额外数据进行分析。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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