寄生虫与媒介生物钟介导高效疟疾传播

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE284425

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疟疾传播始于按蚊在吸血时注入唾液和疟原虫。由于按蚊是夜行性昆虫，我们研究了其唾液腺是否受昼夜节律调控，从而预判吸血行为并调节寄生虫生物学特性以应对宿主接触。在此，我们发现蚊子唾液腺转录组中约有一半，特别是对高效吸血至关重要的基因（如抗凝血因子），表现出昼夜节律性表达。此外，通过测量血红蛋白水平，我们证明蚊子在夜间更倾向于吸血并摄入更多血液。值得注意的是，我们发现唾液腺内寄生虫转录组中有相当一部分在整个白天呈周期性变化，表明该阶段在转录上并非静止。在呈节律性表达的孢子体基因中，包括与寄生虫运动相关的基因，可能调节其在一天中不同时间启动感染的能力。我们的研究结果表明，媒介、寄生虫和哺乳动物宿主之间存在昼夜节律的三方关系，共同调节疟疾传播。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。