盲眼洞穴鱼视网膜变性定量遗传分析数据集

该数据集包含盲眼洞穴鱼(Astyanax mexicanus)的视网膜厚度测量数据、遗传图谱及QTL分析结果,涉及图像(组织切片)和基因测序等多种模态,主要用于研究视网膜退化的遗传基础,为探索视网膜色素变性等眼疾的致病基因和机制提供重要的进化模型数据。

Figshare
2016-01-18 更新
创建时间2016-01-18
更新时间2016-01-18
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https://figshare.com/articles/dataset/Quantitative_Genetic_Analysis_of_Retinal_Degeneration_in_the_Blind_Cavefish_Astyanax_mexicanus__/627180

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资源简介

该数据集针对盲眼洞穴鱼(Astyanax mexicanus)的视网膜变性进行定量遗传分析研究。数据集包含115个F2杂交后代的个体视网膜各层厚度测量数据,以及通过下一代测序(RAD-seq)和微卫星标记构建的高密度遗传图谱。数据来源于对洞穴鱼(无眼型)和地表鱼(有眼型)的杂交实验,结合数量性状位点(QTL)扫描,识别了与视网膜各层厚度相关的四个QTL区域,并定位了候选基因。该数据集主要用于研究视网膜退化的遗传机制,为视网膜色素变性等眼疾的基因研究提供进化突变模型支持。

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影像Quantitative Genetic Analysis of Retinal Degeneration in the Blind Cavefish Astyanax mexicanus