盲眼洞穴鱼视网膜变性定量遗传分析数据集
该数据集包含盲眼洞穴鱼（Astyanax mexicanus）的视网膜厚度测量数据、遗传图谱及QTL分析结果，涉及图像（组织切片）和基因测序等多种模态，主要用于研究视网膜退化的遗传基础，为探索视网膜色素变性等眼疾的致病基因和机制提供重要的进化模型数据。
基本信息
资源简介
盲眼洞穴鱼视网膜变性定量遗传分析数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Quantitative Genetic Analysis of Retinal Degeneration in the Blind Cavefish Astyanax mexicanus》。配套论文《Quantitative Genetic Analysis of Retinal Degeneration in the Blind Cavefish Astyanax mexicanus》发表于 PLoS ONE（2013），DOI：10.1371/journal.pone.0057281。源站首次发布：2013-02-20。
【数据内容】
源站原始描述：The retina is the light-sensitive tissue of the eye that facilitates vision. Mutations within genes affecting eye development and retinal function cause a host of degenerative visual diseases, including retinitis pigmentosa and anophthalmia/microphthalmia. The characin fish Astyanax mexicanus includes both eyed (surface fish) and eyeless (cavefish) morphs that initially develop eyes with normal retina; however, early in development, the eyes of cavefish degenerate. Since both surface and cave mo…
文件 Figure_S1.eps 为文本内容，开头为：%!PS-Adobe-3.1 EPSF-3.0 %ADO_DSC_Encoding: MacOS Roman %%Title: Figure_S1.eps %%Creator: Adobe Illustrator(R) 13.0 %%For: Kelly O''Quin %%CreationDate: 1/24/13 …
【数据结构与技术规格】
文件数 4 个，合计 1.81 MB。Figure_S1.eps：application/postscript，1.19 MB。Table_S1.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，50.48 KB。Table_S2.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，153.59 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0057281。
【主题与分类】
源站学科分类：Neuroscience、Genetics、Evolutionary Biology、Medicine。主题标签：quantitative、retinal、degeneration、cavefish。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Neuroscience、Genetics、Evolutionary Biology、Medicine。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Quantitative_Genetic_Analysis_of_Retinal_Degeneration_in_the_Blind_Cavefish_Astyanax_mexicanus__/627180
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：E. O''Quin, Kelly; Yoshizawa, Masato; Doshi, Pooja; R. Jeffery, William (2016). Quantitative Genetic Analysis of Retinal Degeneration in the Blind Cavefish Astyanax mexicanus. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-07，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集针对盲眼洞穴鱼（Astyanax mexicanus）的视网膜变性进行定量遗传分析研究。数据集包含115个F2杂交后代的个体视网膜各层厚度测量数据，以及通过下一代测序（RAD-seq）和微卫星标记构建的高密度遗传图谱。数据来源于对洞穴鱼（无眼型）和地表鱼（有眼型）的杂交实验，结合数量性状位点（QTL）扫描，识别了与视网膜各层厚度相关的四个QTL区域，并定位了候选基因。该数据集主要用于研究视网膜退化的遗传机制，为视网膜色素变性等眼疾的基因研究提供进化突变模型支持。
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