侵袭性与非侵袭性促性腺激素细胞垂体肿瘤中microRNA表达水平
该数据集包含20个促性腺激素细胞垂体肿瘤样本的小RNA测序数据,数据模态为基因表达(microRNA读数计数),通过Ion Proton测序和miRDeep2分析获得,主要应用于比较侵袭性与非侵袭性垂体肿瘤中microRNA的表达谱,以探索肿瘤进展的分子机制并识别潜在的生物标志物或治疗靶点。

基本信息
资源简介
侵袭性与非侵袭性促性腺激素细胞垂体肿瘤中microRNA表达水平
【数据集背景】
本数据集源站标题为《The expression level of microRNA in invasive and nonivasive gonadotrph pituitary tumors》。项目资助方:Zaburzenia ekspresji mikroRNA w nieczynnych hormonalnie gruczolakach przysadki - ocena roli w patogenezie i potencjalnego znaczenia prognostycznego.。源站首次发布:2024-05-10。
【数据内容】
源站原始描述:The data include the normalized read counts from smallRNA sequencing of 20 RNA samples from gonadotroph pituitary tumors The quality of small RNA fractions was assessed using Agilent 2100 Bioanalyzer with Small RNA Kit Chip (Agilent) and measured with Qubit RNA HS Assay Kits (Thermo Fisher Scientific). One μg of total RNA was used for sequencing library construction with an Ion Total RNA-Seq Kit v2 (Thermo Fisher Scientific), according to the manufacturer’s protocol. Ion Xpress™ R…
文件 count_matrix_miRNA.csv 为文本内容,开头为:invasive growth;non_inv;non_inv;inv;inv;non_inv;non_inv;non_inv;non_inv;non_inv;non_inv;non_inv;non_inv;inv;inv;inv;inv;inv;non_inv;inv;inv saple code;10_14;…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 151.21 KB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.11173667。
【主题与分类】
主题标签:microRNA、Invasive tumor growth、Pituitary tumor。
【获取与许可】
源站页面:https://zenodo.org/records/11173667
使用许可:cc-by-4.0。
规范引用:International Journal of Endocrinology
下载信息
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使用方式
数据集获取(Zenodo 公开直链)
源站:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.11173666
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数据说明
该数据集包含20个促性腺激素细胞垂体肿瘤样本的小RNA测序归一化读数计数。数据通过Ion Proton测序仪获取,使用miRDeep2进行已知人类microRNA(基于miRBase v.22)的比对和定量,并通过DESeq2进行归一化处理。数据集主要用于研究侵袭性与非侵袭性促性腺激素细胞垂体肿瘤中microRNA的表达差异,为垂体肿瘤的分子机制、生物标志物发现及潜在治疗靶点提供数据支持。
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