全基因组SNP连锁分析提示6p21为强直性脊柱炎和炎性背痛特征的易感位点
该数据集包含78名强直性脊柱炎患者的临床表型信息（如炎性背痛、关节炎、HLA-B27状态）和全基因组SNP基因分型数据，数据模态涉及临床表格和基因组变异数据，主要用于通过连锁分析定位强直性脊柱炎的遗传易感位点，尤其聚焦于6p21区域与疾病表型的关联研究。
基本信息
资源简介
全基因组SNP连锁分析提示6p21为强直性脊柱炎和炎性背痛特征的易感位点
【数据集背景】
本数据集源站标题为《A Genome-Wide SNP Linkage Analysis Suggests a Susceptibility Locus on 6p21 for Ankylosing Spondylitis and Inflammatory Back Pain Trait》。配套论文《A Genome-Wide SNP Linkage Analysis Suggests a Susceptibility Locus on 6p21 for Ankylosing Spondylitis and Inflammatory Back Pain Trait》发表于 PLOS ONE（2016），DOI：10.1371/journal.pone.0166888。源站首次发布：2016-12-14。
【数据内容】
源站原始描述：Objectives To screen susceptibility loci for ankylosing spondylitis (AS) using an affected-only linkage analysis based on high-density single nucleotide polymorphisms (SNPs) in a genome-wide manner. Patients and Methods AS patients from ten families with Cantonese origin of China were enrolled in the study. Blood samples were genotyped using genomic DNA derived from peripheral blood leukocytes by Illumina HumanHap 610-Quad SNP Chip. Genotype data were generated using the Illumina BeadStudio 3.2…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 235.18 KB。pone.0166888.s001.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，213.93 KB。pone.0166888.s002.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，21.25 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0166888。
【主题与分类】
源站学科分类：Medicine、Genetics、Biotechnology、Environmental Sciences not elsewhere classified、Ecology、Immunology。主题标签：Illumina HumanHap 610- Quad SNP Chip、susceptibility locus region、non-parameter linkage analysis、susceptibility locus、affected-only linkage analysis、PLINK、6 p 21、Illumina BeadStudio 3.2 software、Genome-Wide SNP Linkage Analysis Suggests、screen susceptibility loci。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medicine、Genetics、Biotechnology、Environmental Sciences not elsewhere classified、Ecology、Immunology。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/A_Genome-Wide_SNP_Linkage_Analysis_Suggests_a_Susceptibility_Locus_on_6p21_for_Ankylosing_Spondylitis_and_Inflammatory_Back_Pain_Trait/4433192
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Zhang, Yanli; Liao, Zetao; Wei, Qiujing; Pan, Yunfeng; Wang, Xinwei; Cao, Shuangyan; et al. (2016). A Genome-Wide SNP Linkage Analysis Suggests a Susceptibility Locus on 6p21 for Ankylosing Spondylitis and Inflammatory Back Pain Trait. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-31，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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数据说明
该数据集是一个基于全基因组单核苷酸多态性（SNP）的遗传连锁分析研究，旨在探索强直性脊柱炎（AS）的遗传易感位点。数据来源于10个中国广东籍AS患者家系，包含78名AS患者的临床表型信息（如发病年龄、病程、炎性背痛、外周关节炎、HLA-B27阳性等）以及通过Illumina HumanHap 610-Quad SNP芯片获取的基因组SNP基因分型数据。研究采用非参数和参数连锁分析方法，在6p21区域发现了一个与AS、炎性背痛（IBP）及HLA-B27相关的易感位点。该数据集适用于遗传学、风湿免疫病研究领域，尤其可用于AS的遗传机制探索和易感基因定位。
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