非洲巴西人群血压控制基因差异甲基化与原发性高血压关联研究数据集
该数据集包含来自非洲巴西人群的80份外周血样本的全基因组DNA甲基化数据,涵盖正常血压者和高血压患者,通过Infinium Methylation EPIC BeadChip平台生成,数据模态为表观遗传学甲基化谱。其主要用途是研究原发性高血压的表观遗传基础,识别与血压调控相关的差异甲基化位点和区域,为高血压的分子机制探索、生物标志物发现及个性化防治策略提供数据支持。
基本信息
资源简介
该数据集是一项针对非洲巴西人群(来自巴西里贝拉河谷地区)的表观遗传学研究,旨在探索DNA甲基化与原发性高血压(EH,定义为血压≥140/90 mmHg)易感性之间的关联。研究通过Infinium Methylation EPIC BeadChip平台对80份外周血样本(包括39名正常血压者和41名高血压患者)进行了全基因组甲基化分析,并使用ChAMP软件包进行数据处理,同时参考了EWAS Atlas、GWAS catalog、GeneCards等数据库以及VarElect、EWAS Toolkit等工具。分析结果揭示了190个差异甲基化CpG位点(DMPs)和46个差异甲基化区域(DMRs),其中27个DMPs与血压调控相关,而DMRs则映射到ABAT、BLCAP、CERS3、EIF4E、FMN1、GABBR1、HLA-DQB2、HOXA5、IL5RA、KCNH2、MIR487B、MIR539、MIR886、MKRN3、NUDT12、PON3、RNF39、RWDD3和TSHBS1等基因。该数据集为理解高血压的表观遗传机制提供了重要资源,主要应用于高血压的分子流行病学、表观遗传标志物发现以及精准医疗研究方向。
下载信息
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暂未开放公开下载
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使用方式
数据集获取(Figshare)
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数据说明
该数据集是一项针对非洲巴西人群(来自巴西里贝拉河谷地区)的表观遗传学研究,旨在探索DNA甲基化与原发性高血压(EH,定义为血压≥140/90 mmHg)易感性之间的关联。研究通过Infinium Methylation EPIC BeadChip平台对80份外周血样本(包括39名正常血压者和41名高血压患者)进行了全基因组甲基化分析,并使用ChAMP软件包进行数据处理,同时参考了EWAS Atlas、GWAS catalog、GeneCards等数据库以及VarElect、EWAS Toolkit等工具。分析结果揭示了190个差异甲基化CpG位点(DMPs)和46个差异甲基化区域(DMRs),其中27个DMPs与血压调控相关,而DMRs则映射到ABAT、BLCAP、CERS3、EIF4E、FMN1、GABBR1、HLA-DQB2、HOXA5、IL5RA、KCNH2、MIR487B、MIR539、MIR886、MKRN3、NUDT12、PON3、RNF39、RWDD3和TSHBS1等基因。该数据集为理解高血压的表观遗传机制提供了重要资源,主要应用于高血压的分子流行病学、表观遗传标志物发现以及精准医疗研究方向。
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