PRJNA706441:细胞间通讯调控房水外流途径并为青光眼治疗提供新靶点

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,属于眼及附器疾病/青光眼分类,主题为转录组或基因表达。研究利用 10x Genomics Chromium 平台,对 6 周龄野生型与神经嵴特异性 Angpt1 敲除小鼠的虹膜角膜角区域进行单细胞转录组测序,以解析该区域各细胞类型结构,并借助 Schl

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时间序列分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA706441: Cellular crosstalk regulates the aqueous humor outflow pathway and provides new targets for glaucoma therapies

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA706441:细胞间通讯调控房水外流途径并为青光眼治疗提供新靶点

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,属于眼及附器疾病/青光眼分类,主题为转录组或基因表达。研究利用 10x Genomics Chromium 平台,对 6 周龄野生型与神经嵴特异性 Angpt1 敲除小鼠的虹膜角膜角区域进行单细胞转录组测序,以解析该区域各细胞类型结构,并借助 Schlemm 管缺失模型识别 Schlemm 管内皮细胞。数据可用于分析小梁网与 Schlemm 管之间的细胞通讯,以及 Angpt1 在虹膜角膜角形成中的作用(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Angiopoietin-1 信号对 Schlemm 管的发育至关重要,Schlemm 管是位于虹膜角膜角的大型淋巴样内皮血管。单细胞 RNA 测序是强大的工具,可用于检查组织内每种细胞类型的特定转录组。在此,我们使用单细胞 RNA 测序检查小鼠虹膜角膜角的结构,利用神经嵴特异性 Angpt1 敲除小鼠中 Schlemm 管的缺失来帮助识别 Schlemm 管内皮细胞。该数据集为分析小梁网/Schlemm 管通讯以及 Angpt1 在虹膜角膜角形成中的作用提供了资源。总体设计:使用 10x Genomics Chromium 平台从 6 周龄野生型和神经嵴特异性 Angpt1 敲除小鼠的虹膜角膜角区域获取单细胞转录组。

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:眼及附器疾病/青光眼。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA706441

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

血管生成素-1信号传导对于施莱姆管(Schlemm’s canal)的发育至关重要,施莱姆管是位于虹膜角膜角的大型淋巴样内皮血管。单细胞RNA测序是一种强大的工具,能够检测组织中每种细胞类型的特异性转录组。在本研究中,我们利用单细胞RNA测序来检查小鼠虹膜角膜角的结构,并利用神经嵴特异性Angpt1敲除小鼠中施莱姆管的缺失来辅助鉴定施莱姆管内皮细胞。该数据集为分析小梁网/施莱姆管之间的交互作用以及Angpt1在虹膜角膜角形成中的作用提供了资源。总体设计:使用10x Genomics Chromium平台从6周龄野生型和神经嵴特异性Angpt1敲除小鼠的虹膜角膜角区域获取单细胞转录组。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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