PRJDB9914：人角膜内皮转录组数据集

该数据集为来自七名无眼部疾病的高加索人眼球的角膜内皮经核糖体RNA去除后的总RNA转录组数据。角膜内皮是角膜五层结构之一，增殖能力有限，易受Fuchs内皮性角膜营养不良、侵入性白内障手术、青光眼手术及内皮炎等病理条件损伤，导致角膜透明度丧失和严重视力障碍

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基因组Transcriptome or Gene expression

PRJDB9914: Transcriptome dataset of human corneal endothelium

基本信息

模态

基因组

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJDB9914：人角膜内皮转录组数据集

PRJDB9914 是一个聚焦人类角膜内皮转录组的数据集，来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），在本站归类于“眼及附器疾病 / 青光眼”方向。该数据集提供了来自七名无眼部疾病的高加索人眼球的角膜内皮样本，经核糖体 RNA 去除后的总 RNA 转录组数据，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”。角膜内皮作为角膜五层结构之一，增殖能力有限，容易受到多种病理条件损伤，例如 Fuchs 内皮性角膜营养不良（FECD；OMIM ID：204870）、侵入性白内障手术、青光眼手术以及内皮炎等，这些损伤可导致角膜透明度丧失，进而引起严重视力障碍。因此，该数据集有助于研究角膜的功能与功能障碍，也可用于与非编码 RNA 数据整合的扩展转录组分析。

【数据集背景】

角膜内皮是角膜的五层结构之一，其增殖能力有限。正因如此，角膜内皮在受到多种病理条件影响时容易发生损伤。这些病理条件包括 Fuchs 内皮性角膜营养不良（FECD；OMIM ID：204870）、侵入性白内障手术、青光眼手术以及内皮炎等。上述损伤可导致角膜透明度丧失，并进一步造成严重视力障碍。该数据集正是围绕角膜内皮的转录组特征而建立，旨在为角膜功能与功能障碍研究提供数据基础，同时也为与非编码 RNA 数据整合的扩展转录组分析提供支持。

【数据内容】

该数据集为转录组数据，具体为来自角膜内皮的总 RNA 经核糖体 RNA 去除后所获得的转录组数据。样本来源为七名无眼部疾病的高加索人眼球。数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”。源站描述指出，该数据集可用于研究角膜的功能/功能障碍，也可用于与非编码 RNA 数据整合的扩展转录组分析。除上述内容外，关于数据的具体规模、测序平台、读长、基因表达矩阵或注释信息等，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。样本来自七名无眼部疾病的高加索人眼球，取材部位为角膜内皮。所提取的 RNA 为总 RNA，并经过核糖体 RNA 去除处理，随后用于转录组分析。数据集英文名为“PRJDB9914: Transcriptome dataset of human corneal endothelium”。关于样本采集的具体机构、伦理审批信息、采集时间、地点以及处理流程的详细步骤，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于研究角膜内皮的功能与功能障碍。由于角膜内皮增殖能力有限，且易受 Fuchs 内皮性角膜营养不良、侵入性白内障手术、青光眼手术及内皮炎等病理条件损伤，导致角膜透明度丧失和严重视力障碍，因此该数据集可用于探索这些病理过程相关的转录组变化。此外，该数据集还可用于与非编码 RNA 数据整合的扩展转录组分析。在本站分类中，该数据集归属于“眼及附器疾病 / 青光眼”方向，因此也可能与青光眼相关研究产生关联。关于具体的分析应用案例或已验证的使用场景，源站未提供。

【使用方法】

该数据集为转录组数据，可用于基因表达分析以及与非编码 RNA 数据的整合分析。使用者可根据研究目的，对角膜内皮转录组数据进行功能或功能障碍相关分析。由于数据来源于无眼部疾病的高加索人眼球，可作为正常角膜内皮的参考数据之一。关于数据下载方式、文件格式、预处理步骤、分析工具或代码等具体使用方法，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的样本来自七名无眼部疾病的高加索人眼球，样本量有限，且人群背景为高加索人。角膜内皮增殖能力有限，这一生物学特性可能影响样本的获取与实验设计。此外，该数据集为核糖体 RNA 去除后的总 RNA 转录组数据，适用于转录组分析，但关于数据的具体质量指标、测序深度、覆盖度、重复性以及潜在偏差等信息，源站未提供。使用者在解释结果时需考虑样本量、人群背景以及数据生成过程中可能存在的限制。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，英文名为“PRJDB9914: Transcriptome dataset of human corneal endothelium”。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及相关发表文献等信息，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB9914

访问原始数据

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJDB9914

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自7名无眼部疾病白种人眼组织的角膜内皮经核糖体RNA去除后的总RNA转录组数据集。由于角膜内皮作为角膜五个不同层次之一，其增殖能力有限，多种病理状况如Fuchs内皮性角膜营养不良（FECD；OMIM ID：204870）、侵入性白内障手术、青光眼手术及内皮炎等对角膜内皮的损伤，会导致角膜透明度丧失，进而引起严重的视觉障碍。因此，该数据集对于研究角膜的功能/功能障碍以及与非编码RNA数据整合的扩展转录组分析应具有重要价值。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别