CODEX多重成像技术用于人类和小鼠黑色素瘤免疫治疗研究数据集

该数据集通过CODEX多重成像技术获取了人类和小鼠黑色素瘤组织在免疫治疗过程中的高维空间蛋白质表达数据,包含单细胞水平的40多种抗体荧光强度值,数据模态为空间蛋白质组学图像与定量表格,主要用于研究肿瘤微环境、免疫细胞浸润及免疫治疗响应机制等肿瘤免疫学方向。

DataONE
2023-12-22 更新
黑色素瘤多重成像
创建时间2023-12-23
更新时间2023-12-22
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https://search.dataone.org/view/sha256:a65d593eeecbb0e95aecf54d547838b3cd7711619d994dd61ee8832a37b3b2b3

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资源简介

该数据集是一个基于CODEX(Co-Detection by Indexing)多重成像技术的单细胞水平数据集,旨在研究人类和小鼠黑色素瘤在免疫治疗过程中的肿瘤微环境。数据集包含来自小鼠模型和人类患者黑色素瘤组织的样本,通过40多种抗体标记的DNA寡核苷酸条形码进行组织染色,并利用CODEX成像系统获取高维空间蛋白质表达图像。数据经过图像拼接、漂移补偿、去卷积、单细胞分割和Z-score标准化等处理,最终以行为单个细胞、列为40多种抗体荧光强度值的矩阵形式呈现。该数据集主要用于肿瘤免疫学、肿瘤微环境分析、免疫治疗响应机制以及空间转录组学等研究方向。

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