一种用于严重角膜感染微生物学诊断的新方法

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05888987

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：感染性角膜炎、微生物性角膜炎、角膜感染。将在法国兰斯Robert Debré医院眼科招募46名重症感染性角膜炎患者。该研究将分为2组。第一组，也称为“前组”，将包含23名先前因重症感染性角膜炎在我院病房住院的患者。他们接受了标准的微生物学诊断方法：革兰染色直接显微镜检查、细菌和真菌培养、病毒和阿米巴聚合酶链反应[PCR]。第二组，也称为“后组”，将招募患有重症感染性角膜炎的患者（前瞻性组）。每位患者将接受完整的眼科检查、角膜刮片和拭子以进行标准微生物学诊断方法，同时另取一份角膜拭子样本用于两种不同的FilmArray® PCR系统，分别标识为“ME”（脑膜炎-脑炎）和“BCID”（血培养鉴定）。

研究人员假设，未来在严重角膜感染的微生物学诊断中使用快速多重PCR检测，可能比当前的诊断策略更为高效。一方面，这能缩短鉴定病原体的时间，从而更快实施针对性治疗；另一方面，能系统性地筛查大量病原体，远超目前所针对的范围。此外，这项技术应用于眼科领域所带来的益处，还可能改善患者的长期视觉预后，缩短住院时间，进而降低这些患者的诊断和管理成本。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。