视网膜动静脉畸形诊断相关数据集

欧洲蛋白质数据库(PDBe)(2010)。CCM3的晶体结构,一种对血管完整性至关重要的脑血管海绵状畸形蛋白[数据集]。主题标签:视网膜动静脉畸形、眼及附器疾病、CCM3、脑血管海绵状畸形、晶体结构、血管完整性、PDBe

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蛋白质分类视网膜动静脉畸形眼及附器疾病CCM3脑血管海绵状畸形晶体结构血管完整性PDBe
Data from: Insights in the diagnosis of a retinal arteriovenous malformation

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

视网膜动静脉畸形诊断相关数据集

Data from: Insights in the diagnosis of a retinal arteriovenous malformation 是一项收录于眼及附器疾病/其他分类下的数据集,来源站为 ebi.ac.uk。该数据集与欧洲蛋白质数据库(PDBe)2010 年发布的一项晶体结构数据相关,其源站描述指向 CCM3 蛋白的晶体结构;CCM3 被描述为一种对血管完整性至关重要的脑血管海绵状畸形蛋白。围绕视网膜动静脉畸形的诊断主题,该数据集在主题标签上同时关联视网膜动静脉畸形、眼及附器疾病、CCM3、脑血管海绵状畸形、晶体结构、血管完整性以及 PDBe 等关键词。整体而言,它呈现的是与血管畸形相关蛋白结构信息相联系的科研数据资源,面向对眼科疾病、血管完整性及蛋白质结构研究感兴趣的读者。

【数据集背景】

该数据集的背景与视网膜动静脉畸形的诊断研究相关。视网膜动静脉畸形属于眼及附器疾病范畴,而数据集的英文名称明确指向“Insights in the diagnosis of a retinal arteriovenous malformation”,即关于视网膜动静脉畸形诊断的见解。与此同时,其源站描述来自欧洲蛋白质数据库(PDBe)2010 年发布的一项数据集,内容为 CCM3 的晶体结构。CCM3 被描述为一种脑血管海绵状畸形蛋白,对血管完整性具有关键作用。由此,该数据集将眼科血管畸形的诊断主题与血管完整性相关蛋白的结构研究联系起来,形成跨领域的背景脉络。

【数据内容】

数据内容的核心指向 CCM3 的晶体结构。根据源站描述,该结构数据由欧洲蛋白质数据库(PDBe)于 2010 年发布,标题为“Crystal structure of CCM3, a cerebral cavernous malformation protein critical for vascular integrity”。主题标签进一步显示,该数据集涉及视网膜动静脉畸形、眼及附器疾病、CCM3、脑血管海绵状畸形、晶体结构、血管完整性以及 PDBe。除上述信息外,源站未提供关于具体结构解析方法、分辨率、坐标文件内容或样本数量的更多细节。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ebi.ac.uk,源站描述明确标注为欧洲蛋白质数据库(PDBe)(2010)。其数据集条目以 DOI 形式给出:http://doi.org/10.2210/pdb/3l8i/pdb。这表明数据来源于 PDBe 的蛋白质结构数据发布渠道。除来源站、发布年份与 DOI 外,源站未提供关于采集方式、实验条件或样本来源的进一步说明。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于与视网膜动静脉畸形诊断相关的主题探索,也可用于关注 CCM3 蛋白、脑血管海绵状畸形、血管完整性以及晶体结构的研究场景。由于主题标签同时涵盖眼及附器疾病与蛋白质结构,它可能服务于眼科疾病机制、血管畸形相关蛋白结构等交叉领域的检索与参考。除这些由主题标签和源站描述直接支持的场景外,源站未提供其他具体适用场景。

【使用方法】

源站未提供关于该数据集具体使用方法的说明。现有信息仅包含数据集名称、分类、来源站、源站描述与主题标签,未涉及数据下载、解析、可视化或分析流程的指引。

【质量与限制】

源站未提供关于该数据集质量评估或使用限制的说明。现有信息未包含数据完整性、准确性、分辨率、覆盖范围或使用条件等方面的具体描述。

【引用与许可】

该数据集的引用信息可参考源站描述中的条目:Protein Data Bank in Europe (PDBe) (2010). Crystal structure of CCM3, a cerebral cavernous malformation protein critical for vascular integrity [Dataset]. http://doi.org/10.2210/pdb/3l8i/pdb。除该引用条目与 DOI 外,源站未提供关于许可条款的更多信息。

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源站:https://ebi.ac.uk/pdbe/entry/pdb/3L8I

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Protein Data Bank in Europe (PDBe) (2010). Crystal structure of CCM3, a cerebral cavernous malformation protein critical for vascular integrity [Dataset]. http://doi.org/10.2210/pdb/3l8i/pdb

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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