昼夜节律时钟基因表观遗传激活引发实验性小鼠干眼炎症
该数据集提供了实验性小鼠干眼症模型的多模态数据，包括RNA测序获得的基因表达谱、RT-qPCR和Western blot检测的炎症因子与昼夜节律基因表达水平、Per基因启动子甲基化状态测定结果以及基因敲低体外实验数据，主要应用于探究昼夜节律时钟基因通过表观遗传机制调控干眼炎症反应的分子病理机制研究。
基本信息
资源简介
昼夜节律时钟基因表观遗传激活引发实验性小鼠干眼炎症
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Epigenetic Activation of Circadian Clock Genes Elicits Inflammation in Experimental Murine Dry Eye》。配套论文《Epigenetic Activation of Circadian Clock Genes Elicits Inflammation in Experimental Murine Dry Eye》发表于 Ocular Immunology and Inflammation（2023），DOI：10.1080/09273948.2023.2205525。项目资助方：This work was supported, in part, by the National Natural Science Foundation of China (82171021&81970770&82070932)。源站首次发布：2023-05-10。
【数据内容】
源站原始描述：To explore whether circadian clock genes contribute to elicit inflammation in experimental dry eye (EDE). RNA sequencing analyzed mRNA expression patterns in EDE model. RT-qPCR and/or Western blot determined the expression of inflammatory factors and circadian genes during EDE. MethylTarget™ assays determined the promoter methylation levels of Per genes in vivo. Per2 or Per3 knockdown assessed their effects on inflammatory factors in vitro. We utilized an intelligently controlled environmental s…
【数据结构与技术规格】
文件数 6 个，合计 1.50 MB。Supplementary Figure S1.tif：image/tiff，76.71 KB。Supplementary Table S1.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，21.29 KB。Supplementary Table S2.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，18.63 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.22796070.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Genetics、Molecular Biology、Neuroscience、Physiology、Pharmacology、Ecology。主题标签：Circadian clock genes、DNA methylation、dry eye、inflammation、PER2。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Genetics、Molecular Biology、Neuroscience、Physiology、Pharmacology、Ecology。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Epigenetic_Activation_of_Circadian_Clock_Genes_Elicits_Inflammation_in_Experimental_Murine_Dry_Eye/22796070
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Epigenetic Activation of Circadian Clock Genes Elicits Inflammation in Experimental Murine Dry Eye. Taylor & Francis. Wei, Ruifen; Chen, Qianqian; Zheng, Qinxiang; Reinach, Peter S.; Tan, Xiying; Pan, Chengjie; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2024-08-27，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集聚焦于实验性干眼症（EDE）模型，旨在探究昼夜节律时钟基因是否参与引发干眼炎症。数据集包含通过RNA测序分析的EDE模型mRNA表达谱、RT-qPCR和Western blot检测的炎症因子与昼夜节律基因表达数据、Per基因启动子甲基化水平的MethylTarget™测定结果，以及Per2或Per3基因敲低对体外炎症因子影响的实验数据。数据来源于利用智能控制环境系统（ICES）建立的小鼠EDE模型，研究揭示了PER2和PER3在EDE过程中呈现振荡性、时间依赖性的上调及其启动子低甲基化现象，并通过体外实验验证了PER2/PER3沉默可降低炎症因子表达。该数据集主要应用于干眼症分子病理机制、昼夜节律与表观遗传调控在眼部炎症中的作用等研究方向。
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