原发性人类角膜上皮细胞在HSV-1感染下的长链非编码RNA转录谱与整合分析
该数据集包含原发性人类角膜上皮细胞在单纯疱疹病毒-1（HSV-1）感染后的基因表达数据，涉及长链非编码RNA和信使RNA的转录组表达谱，数据模态为基因表达谱数据，主要通过微阵列技术获取，并辅以qRT-PCR验证和生物信息学分析，主要用于研究疱疹性角膜炎的发病机制、探索lncRNA的调控功能以及识别潜在的分子治疗靶点。
基本信息
资源简介
原发性人类角膜上皮细胞在HSV-1感染下的长链非编码RNA转录谱与整合分析
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Transcriptional Profile and Integrative Analyses of Long Noncoding RNAs in Primary Human Corneal Epithelial Cells in Response to HSV-1 Infection》。配套论文《Transcriptional Profile and Integrative Analyses of Long Noncoding RNAs in Primary Human Corneal Epithelial Cells in Response to HSV-1 Infection》发表于 Current Eye Research（2018），DOI：10.1080/02713683.2018.1504085。项目资助方：This study is supported by the National Natural Science Foundation of China (81770897, 81570814, 81300271), Natural Science Foundation of Guangdong Province, China (2014A030313363, 2017A030313582, 2017A030313544) and Scientific Research project of Guangzhou Municipal Education Department (1201410345; Guangzhou City, Guangdong Province, China)。源站首次发布：2018-08-17。
【数据内容】
源站原始描述：Long noncoding RNAs (lncRNAs) have been demonstrated to have important regulatory functions in diverse cellular processes; however, the role of lncRNAs in the pathogenesis of herpes simplex keratitis (HSK) remains poorly understood. Primary human corneal epithelial cells (HCECs) were infected with herpes simplex virus-1 (HSV-1) and the total RNAs extracted from both the infected group and the mock-infected group subjected to microarray analysis to identify the differential expression of lncRNAs…
【数据结构与技术规格】
文件数 3 个，合计 3.89 MB。Supplementaru Figure 1_legend.pdf：application/pdf，148.54 KB。Supplementary Table 1.pdf：application/pdf，14.23 KB。ncer-2018-0163-File009.tif：image/tiff，3.73 MB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.6981767.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Biochemistry、Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology。主题标签：Long noncoding RNAs、cornea、epithelial cells、HSV-1、viral infection。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biochemistry、Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Transcriptional_Profile_and_Integrative_Analyses_of_Long_Noncoding_RNAs_in_Primary_Human_Corneal_Epithelial_Cells_in_Response_to_HSV-1_Infection/6981767
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Transcriptional Profile and Integrative Analyses of Long Noncoding RNAs in Primary Human Corneal Epithelial Cells in Response to HSV-1 Infection. Taylor & Francis. Cui, Yu-Hong; Song, Xi-Ling; Hu, Zi-Xuan; Yang, Guang; Li, Zhi-Jie; Pan, Hong-Wei
【使用注意】
· 源站最后修改于 2024-02-12，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集记录了原发性人类角膜上皮细胞（HCECs）在单纯疱疹病毒-1（HSV-1）感染后的转录组变化。数据内容包括通过微阵列分析获得的差异表达长链非编码RNA（lncRNA）和信使RNA（mRNA）的表达谱，并进行了生物信息学分析，如基因本体（GO）分析、通路分析和共表达网络分析。数据来源于实验组（HSV-1感染）和对照组（模拟感染）的总RNA提取与检测，并通过qRT-PCR验证了微阵列结果的可靠性。该数据集主要用于研究lncRNA在疱疹性角膜炎（HSK）发病机制中的潜在作用，为探索HSK的分子机制和潜在治疗靶点提供线索。
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