博士论文补充数据:CARD-RGI 完美与严格命中

该数据集包含来自博士论文的补充数据,涉及39株铜绿假单胞菌临床分离株的基因组序列,通过FASTA文件格式提供,并利用CARD-RGI工具分析抗生素耐药性基因的完美与严格命中结果,主要用于抗生素耐药性研究、角膜感染模型开发以及临床微生物基因组学分析,支持抗菌药物测试和感染性疾病研究。

orda.shef.ac.uk
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2024-11-08 更新
抗生素抗性角膜感染模型
更新时间2024-11-08
原始链接

https://orda.shef.ac.uk/articles/dataset/PhD_Thesis_Additional_Data_CARD-RGI_Perfect_Strict_Hits/19169657/1

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资源简介

该数据集是博士论文《用于抗菌药物测试的体外角膜感染模型的开发》(Lucy Urwin,2022年,IICD系)的补充数据。论文第四章描述了临床分离株的表征,包括来自印度海得拉巴LV Prasad眼科研究所的39株铜绿假单胞菌分离株。基因组测序由Microbes NG(LVP3-6)、谢菲尔德大学Luke Green博士(LVP3-6)以及韦洛尔基督教医学院Naveen Kumar博士(其他所有分离株)完成。FASTA文件使用综合抗生素耐药性数据库耐药基因标识符(CARD-RGI)进行分析。本文件包含由CARD-RGI识别的抗生素耐药性基因的完美和严格命中详情。数据集主要用于抗生素耐药性基因分析、角膜感染模型研究以及临床微生物基因组学领域。

提供机构:orda.shef.ac.uk

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