单细胞分析识别CD8<sup>bright</sup> CD244<sup>bright</sup>自然杀伤细胞亚群反映HLA-A29阳性鸟枪性脉络膜视网膜炎疾病活动性
该数据集包含通过单细胞分析技术获取的鸟枪性脉络膜视网膜炎患者免疫细胞数据，主要模态为单细胞转录组数据，内容涵盖NK细胞亚群的基因表达、表面标志物及细胞功能特征。数据集旨在揭示HLA-A29阳性患者中CD8bright CD244bright NK细胞亚群与疾病活动性的关联，主要用于自身免疫性眼病的免疫机制探索、生物标志物发现及NK细胞在炎症性疾病中的功能研究。
基本信息
资源简介
单细胞分析识别CD8<sup>bright</sup> CD244<sup>bright</sup>自然杀伤细胞亚群反映HLA-A29阳性鸟枪性脉络膜视网膜炎疾病活动性
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Single-cell profiling identifies a CD8bright CD244bright Natural Killer cell subset that reflects disease activity in HLA-A29-positive birdshot chorioretinopathy.》。配套论文《Single-cell profiling identifies a CD8bright CD244bright Natural Killer cell subset that reflects disease activity in HLA-A29-positive birdshot chorioretinopathy》发表于 Nature Communications（2024），DOI：10.1038/s41467-024-50472-0。源站首次发布：2024-08-01。
【数据内容】
源站原始描述：Birdshot chorioretinopathy is an inflammatory eye condition strongly associated with MHC-I allele HLA-A29. The striking association with MHC-I suggests involvement of T cells, whereas natural killer (NK) cell involvement remains largely unstudied. Here we show that HLA-A29-positive birdshot chorioretinopathy patients have a skewed NK cell pool containing expanded CD16 positive NK cells which produce more proinflammatory cytokines. These NK cells contain populations that express CD8A which is inv…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 121.21 KB。Supplementary Data.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，121.21 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.25858399.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Innate Immunity、Immunogenetics (incl. Genetic Immunology)、Cellular Immunology、Autoimmunity、Clinical Sciences not elsewhere classified、Ophthalmology。主题标签：Uveitis、birdshot chorioretinopathy、natural killer cells、single cell RNA sequencing, single cell RNA-seq、autoimmune、NK cell subsets。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Innate Immunity、Immunogenetics (incl. Genetic Immunology)、Cellular Immunology、Autoimmunity、Clinical Sciences not elsewhere classified、Ophthalmology。
【获取与许可】
源站页面：https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Single-cell_profiling_identifies_a_CD8_sup_bright_sup_CD244_sup_bright_sup_Natural_Killer_cell_subset_that_reflects_disease_activity_in_HLA-A29-positive_i_birdshot_chorioretinopathy_i_/25858399
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Nath, Pulak Ranjan; Maclean, Mary; Nagarajan, Vijayaraj; Wha Lee, Jung; Yakin, Mehmet; Kumar, Aman; et al. (2024). Single-cell profiling identifies a CD8bright CD244bright Natural Killer cell subset that reflects disease activity in HLA-A29-positive birdshot chorioretinopathy.. figshare. Dataset
下载信息
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使用方式
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数据说明
该数据集聚焦于鸟枪性脉络膜视网膜炎（一种与MHC-I等位基因HLA-A29强相关的炎症性眼病）的免疫机制研究。数据集通过单细胞分析技术，揭示了HLA-A29阳性患者体内自然杀伤（NK）细胞池的异常变化，包括扩增的CD16阳性NK细胞亚群及其促炎细胞因子产生增加。研究进一步识别出一个表达CD8A（参与靶细胞MHC-I识别）并具有高细胞毒性基因特征（如GZMB、PRF1和ISG15）的CD8bright CD244bright NK细胞亚群，该亚群通过NK细胞受体CD244（SH2D1B）进行信号传导。通过对活动期患者的长期监测，发现该细胞亚群水平在临床缓解后迅速恢复正常，表明其可作为疾病活动性的潜在生物标志物。数据集主要应用于自身免疫性眼病、NK细胞免疫学及单细胞组学研究方向。
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