phs000835:单细胞分析计划-转录组(SCAP-T)(宾夕法尼亚大学)
该数据集为 NCBI dbGaP 收录的研究 phs000835,即单细胞分析计划-转录组(SCAP-T)宾夕法尼亚大学部分,源站将其标注为 Case Set

基本信息
资源简介
phs000835:单细胞分析计划-转录组(SCAP-T)(宾夕法尼亚大学)
phs000835 是 NCBI dbGaP 收录的一项研究,英文名称为 Single Cell Analysis Program - Transcriptome (SCAP-T) (U. Penn),即单细胞分析计划-转录组(SCAP-T)的宾夕法尼亚大学部分。源站将其标注为 Case Set,主题标签同样为 Case Set。该数据集在本地分类中归入眼病 / 物像不等类别,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。整体而言,这是一项以病例集合形式组织的单细胞转录组研究资源,依托 dbGaP 平台进行登记与发布,可供相关领域研究者在合规前提下申请获取与使用。
【数据集背景】
该数据集对应单细胞分析计划(Single Cell Analysis Program,SCAP)中的转录组(Transcriptome)部分,具体为宾夕法尼亚大学(U. Penn)承担或贡献的内容。单细胞分析计划旨在推动单细胞层面的分析技术发展与应用,而转录组方向关注的是在单个细胞尺度上获取基因表达相关信息。该研究以 phs000835 为编号被 NCBI dbGaP 收录,源站将其标注为 Case Set,说明其在组织形态上属于病例集合类型的研究资源。本地分类将其归入眼病 / 物像不等,提示该资源在分类体系中被关联到眼科与视觉相关方向。关于该研究的具体立项背景、资助信息、研究目标与科学假设,源站未提供。
【数据内容】
从名称与标注来看,该数据集的核心内容是单细胞转录组数据,并以 Case Set 的形式组织。主题标签为 Case Set,表明其样本或受试者被作为病例集合进行登记。单细胞转录组通常涉及在单个细胞分辨率上获得的表达谱信息,但该数据集具体包含哪些样本类型、细胞类型、测序平台、数据文件格式与数据量,源站未提供。数据是否包含原始测序读段、表达矩阵或衍生分析结果,源站未提供。样本数量、受试者数量、分组信息与临床注释字段,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,通过 NCBI dbGaP 平台发布,研究编号为 phs000835。源站描述其为 dbGaP study (Case Set)。其英文名称标明该资源属于单细胞分析计划-转录组(SCAP-T)的宾夕法尼亚大学部分。关于样本采集地点、采集时间、采集流程、伦理审批与知情同意方式,源站未提供。关于测序或数据生成的具体实验方法,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可被用于单细胞转录组相关的研究场景,例如在单细胞层面考察基因表达特征。由于其被标注为 Case Set,并归入眼病 / 物像不等分类,可能适用于与眼科或视觉相关方向的研究探索。然而,具体适用的研究问题、分析目标与疾病模型,源站未提供。该资源是否适合作为对照比较、是否包含对照组,源站未提供。
【使用方法】
该数据集通过 NCBI dbGaP 平台提供,研究编号为 phs000835。通常 dbGaP 收录的研究需要遵循其数据访问流程,但该研究的具体访问级别、申请条件、审批流程与下载方式,源站未提供。数据的具体使用协议、分析工具与处理流程,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集被源站标注为 Case Set,主题标签为 Case Set,说明其以病例集合形式组织。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应、覆盖度与验证情况,源站未提供。该数据集在本地分类中归入眼病 / 物像不等,但该分类与数据内容之间的具体关联依据,源站未提供。使用该数据集时可能受到 dbGaP 数据访问政策与伦理合规要求的约束,具体限制条款源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,研究编号为 phs000835,英文名称为 Single Cell Analysis Program - Transcriptome (SCAP-T) (U. Penn)。关于该数据集的正式引用格式、文献出处、许可条款与使用限制,源站未提供。使用者应依据 NCBI dbGaP 平台的相关规定进行引用与合规使用,具体引用要求与许可信息源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000835
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
dbGaP study (Case Set).
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