嗜铬细胞瘤患者脂肪组织可塑性揭示剪接机制在人体脂肪棕色化中的关键作用
该数据集提供了来自对照个体和嗜铬细胞瘤患者网膜脂肪组织的RNA测序计数数据，包含全基因和转录本异构体两个层面的表达信息，数据模态为基因表达谱（文本/表格格式）。数据通过高通量测序技术获得，主要用于研究脂肪组织可塑性、剪接机制在人类脂肪棕色化过程中的关键作用，支持代谢性疾病、肥胖症及肿瘤微环境相关的基础与转化研究。
基本信息
资源简介
嗜铬细胞瘤患者脂肪组织可塑性揭示剪接机制在人体脂肪棕色化中的关键作用
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Adipose tissue plasticity in pheochromocytoma patients reveals a key role of the splicing machinery in human adipose browning》。源站首次发布：2022-11-17。
【数据内容】
源站原始描述：RNA-sequencing counts data from omental adipose tissue from control individuals (C1-3) and patients with pheochromocytoma (P1-4) for whole genes (genes-counts.tsv) and individual isoforms (isoform-counts.tsv). Additional details regarding recruited individuals are available in the associated manuscript. Tissue fragments (~150 mg) of adipose biopsies from controls and pheochromocytoma patients were homogenized using a metal bead-based mechanical procedure in a TissueLyser® (QIAGEN, Düsse…
主表 genes-counts.tsv 含 7 列、样本前 2000 行结构完整。
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 11.05 MB。数据集 DOI：10.5281/zenodo.7314338。
【主题与分类】
主题标签：brown adipose, pheochromocytoma, browning, adipose, thermogenesis。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/records/7314338
使用许可：cc-by-4.0。
规范引用：iScience
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-01-20，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
源站：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.7314337
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数据说明
该数据集包含来自对照个体（C1-3）和嗜铬细胞瘤患者（P1-4）的网膜脂肪组织的RNA测序计数数据，涵盖全基因（genes-counts.tsv）和单个转录本异构体（isoform-counts.tsv）。数据通过组织匀浆、RNA提取、mRNA纯化、cDNA文库构建及Illumina HiSeq 2000测序平台生成，平均每个样本测序深度约4500万reads。数据经过质量控制（FastQC）和基因表达定量（Salmon），参考基因组为GENCODE version 31（GRCh38.p12）。该数据集主要用于研究嗜铬细胞瘤患者脂肪组织的可塑性，特别是剪接机制在人类脂肪棕色化过程中的作用，为代谢性疾病、肥胖及肿瘤相关脂肪重塑的研究提供基础数据。
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