基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

运动对腹部皮下脂肪组织基因表达影响的数据集

PRJNA480271 是一个来自 NCBI BioProject 的生物学项目数据集，其英文名称为“The effects of exercise on gene expression in abdominal subcutaneous adipose tissue”，即运动对腹部皮下脂肪组织基因表达的影响。该数据集在分类上归属于内分泌、营养和代谢疾病下的肥胖症方向，主题标签为转录组或基因表达。从整体上看，这一数据集围绕运动干预与腹部皮下脂肪组织基因表达之间的关系展开，属于转录组学或基因表达类数据，适合关注肥胖症、代谢调控以及运动生物学的研究者参考使用。其来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，用户可通过 BioProject 编号 PRJNA480271 在 NCBI 平台上定位到该项目的相关记录。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI BioProject，编号为 PRJNA480271。BioProject 是 NCBI 提供的一种资源组织方式，用于汇集与某一项研究计划相关的多种生物学数据。根据源站描述，一个 BioProject 通常来源于单一组织或联合体，旨在围绕同一项研究倡议整合不同类型的数据，并为用户提供一个统一的入口，以便查找该项目所产生的各类数据链接。该数据集的主题聚焦于运动对腹部皮下脂肪组织基因表达的影响，所属分类为内分泌、营养和代谢疾病中的肥胖症，主题标签为转录组或基因表达。这表明该项目的研究背景与运动干预、脂肪组织功能以及基因表达调控相关，可能服务于肥胖症及相关代谢问题的研究。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其数据内容属于转录组或基因表达类型。数据集英文名称明确指出其研究内容是运动对腹部皮下脂肪组织基因表达的影响。因此，从数据主题来看，该项目关注的是在运动条件下，腹部皮下脂肪组织中基因表达所发生的变化。关于具体的样本数量、基因列表、表达量数值、测序平台、实验设计细节等信息，源站未提供。该数据集在分类上属于内分泌、营养和代谢疾病下的肥胖症，提示其数据内容可能与肥胖症相关的代谢机制研究有关。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“The effects of exercise on gene expression in abdo... (ID 480271) - BioProject - NCBI”。其英文名称为“PRJNA480271: The effects of exercise on gene expression in abdominal subcutaneous adipose tissue”。根据源站描述，BioProject 记录为用户提供一个统一的位置，用于查找与某一项目相关的多种数据类型所生成的链接。该项目来源于单一组织或联合体，但具体的组织名称、研究机构、国家、联系人等信息，源站未提供。关于样本采集方式、运动干预方案、受试者信息、测序方法等具体采集细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于转录组或基因表达相关的研究场景，尤其是围绕运动干预与腹部皮下脂肪组织基因表达关系的研究。其分类为内分泌、营养和代谢疾病下的肥胖症，因此可用于肥胖症、代谢调控、脂肪组织生物学以及运动生物学等方向的探索。研究者可以利用该 BioProject 记录查找与之相关的不同类型数据链接，从而获取该项目产生的数据资源。关于该数据集是否适用于临床诊断、药物开发、个性化医疗等具体应用，源站未提供相关信息。

【使用方法】

用户可以通过 NCBI BioProject 平台，使用编号 PRJNA480271 或标题中的相关信息定位到该项目记录。根据源站描述，BioProject 记录提供用户一个单一位置，用于查找与该项目相关的多种数据类型所生成的链接。因此，使用者可以通过该记录访问与之关联的数据资源。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析工具、数据处理流程等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject，属于公开的生物学项目记录。关于数据质量、样本量、测序深度、数据完整性、潜在偏差、质控指标等信息，源站未提供。该数据集的主题标签为转录组或基因表达，分类为内分泌、营养和代谢疾病下的肥胖症，但具体的实验设计、统计方法、结果验证等信息，源站未提供。因此，在使用该数据集时，用户需要结合源站记录中的实际数据链接和相关信息自行评估其适用性与局限性。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“The effects of exercise on gene expression in abdo... (ID 480271) - BioProject - NCBI”。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、数据共享政策等信息，源站未提供。用户在使用该数据集时，应参考 NCBI BioProject 平台上的相关说明以及该项目记录中可能提供的引用要求。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE116801

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA480271

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

运动可改善多种器官系统的健康与福祉，阐明运动对健康有益作用的机制可能为疾病带来新疗法。我们发现，人体运动训练会引起皮下脂肪组织（scWAT）基因表达的深刻变化，包括编码分泌蛋白的基因。此外，我们使用了先前发表的微阵列数据集，该数据集来源于置于静止笼中（久坐对照）或置于带跑轮笼中11天的小鼠的scWAT。在人类和小鼠中受运动训练显著改变的基因，进一步通过基因本体论中细胞外空间的注释进行筛选。在这些基因中，与训练小鼠总跑轮距离相关性最显著的是Tgfb2。我们通过RT-qPCR验证了运动训练可增加人类受试者scWAT中的TGFB2 mRNA。这使我们提出假设：TGF-β2是一种运动诱导的脂肪因子。为确定TGF-β2增加的治疗潜力和机制，我们研究了运动训练和肥胖的小鼠模型。

我们的发现表明，运动训练通过TGF-β2信号通路与脂肪组织进行器官间通讯，从而改善代谢，为对抗代谢性疾病提供了新的机制。总体设计：从健康年轻男性受试者中，在为期12周的运动训练前后，采集腹部皮下脂肪组织（scWAT）活检样本。运动训练方案包括每天60-80分钟骑行，每周5天。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别